RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640939.1

GRAMD1B-217, Transcript of GRAM domain containing 1B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GRAMD1B, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1B-217ENST00000640939 CYP11B1P15538 503 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 TAF5Q15542 800 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 TAF3Q5VWG9 929 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 SYPL2Q5VXT5 272 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 WDR5BQ86VZ2 330 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 CPXM2Q8N436 756 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 IL17RCQ8NAC3 791 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 ADAM32Q8TC27 787 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 MMP17Q9ULZ9 603 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 SIK3Q9Y2K2 1263 aa23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 LGALS16A8MUM7 142 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 CAPN9O14815 690 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 CISD3P0C7P0 127 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 DGKGP49619 791 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 TBX4P57082 545 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 SYCP1Q15431 976 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 LPAL2Q16609 132 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 PRR23BQ6ZRT6 265 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 FAM217AQ8IXS0 508 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 CAMKK1Q8N5S9 505 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 NOX5Q96PH1 765 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 PDCL3Q9H2J4 239 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.44■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 SGK1O00141 431 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 IGLV3-27P01718 113 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 ERBB2P04626 1255 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 CYBBP04839 570 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 UBXN1Q04323 297 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 NUDT18Q6ZVK8 323 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 TAC4Q86UU9 113 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 TSTD1Q8NFU3 115 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 DDI1Q8WTU0 396 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 HINFPQ9BQA5 517 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 BPIFA3Q9BQP9 254 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 POPDC2Q9HBU9 364 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 HCN2Q9UL51 889 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 CLEC4EQ9ULY5 219 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 CEP83Q9Y592 693 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 FAM186AA6NE01 2351 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 GPR179Q6PRD1 2367 aa23.43■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 LRRC10BA6NIK2 292 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 PRRT4C9JH25 899 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 GFPT2O94808 682 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 APBB3O95704 486 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 PTPN20Q4JDL3 420 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 OR6B2Q6IFH4 312 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 TMEM92Q6UXU6 159 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 DCLK2Q8N568 766 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 SERPINB11Q96P15 392 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 TRIM62Q9BVG3 475 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 SYNCQ9H7C4 482 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 STOML2Q9UJZ1 356 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 FBXO10Q9UK96 956 aa23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 SYCE3A1L190 88 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 AXIN1O15169 862 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 ADAM23O75077 832 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 GRAP2O75791 330 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 LATS1O95835 1130 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 CRY1Q16526 586 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 ADGRF1Q5T601 910 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 NUGGCQ68CJ6 796 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 BEND5Q7L4P6 421 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 UNC45BQ8IWX7 931 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 FUCA2Q9BTY2 467 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 EML5Q05BV3 1969 aa23.41■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 CNR2P34972 360 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 WASP42768 502 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 SGSHP51688 502 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 JAM2P57087 298 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 RING1Q06587 406 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 MPPE1Q53F39 396 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 DCAF6Q58WW2 860 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 EOGTQ5NDL2 527 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 RFWD3Q6PCD5 774 aa23.4■■□□□ 1.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 CEP68Q76N32 757 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms