RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503613.5

FBXO38-206, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 627 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-206	ENST00000503613	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	VSTM1	Q6UX27	236 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	C9orf72	Q96LT7	481 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	CASD1	Q96PB1	797 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	OLFM3	Q96PB7	478 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	DEFB118	Q96PH6	123 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	PPCS	Q9HAB8	311 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	RAD54B	Q9Y620	910 aa		11.11	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	C5orf60	A6NFR6	353 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	OR6C75	A6NL08	312 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	TNFRSF10B	O14763	440 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	CXCL10	P02778	98 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	CYP2C18	P33260	490 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	MAGEA11	P43364	429 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	HTRA3	P83110	453 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	SEMA3B	Q13214	749 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	DPYS	Q14117	519 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	KCNJ11	Q14654	390 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	PDIK1L	Q8N165	341 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	C8orf48	Q96LL4	319 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	KLC2	Q9H0B6	622 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	DDIT4	Q9NX09	232 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	COX16	Q9P0S2	106 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	HTT	P42858	3142 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	SMIM23	A6NLE4	172 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613		E7EVH7	732 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	TRIM66	O15016	1216 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	DCLK1	O15075	740 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	CDH16	O75309	829 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	TMEM63A	O94886	807 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	IGLV3-25	P01717	112 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	ALDH2	P05091	517 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	FGFR3	P22607	806 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	PHB	P35232	272 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	GRIK1	P39086	918 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	MMP13	P45452	471 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	PDK1	Q15118	436 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	RASA2	Q15283	850 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	MTFR1	Q15390	333 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	LONRF1	Q17RB8	773 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	LRRC31	Q6UY01	552 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	TDRP	Q86YL5	185 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	MCU	Q8NE86	351 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	EDEM1	Q92611	657 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	CENPT	Q96BT3	561 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	TOX2	Q96NM4	488 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	RNF208	Q9H0X6	261 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	WDCP	Q9H6R7	721 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		11.09	□□□□□ -0.63
FBXO38-206	ENST00000503613	FETUB	Q9UGM5	382 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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