RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429285.6

NCOR2-208, Transcript of nuclear receptor corepressor 2, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCOR2, Length 8,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCOR2-208	ENST00000429285	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	E2F8	A0AVK6	867 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ITGAD	Q13349	1161 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	MYLPF	Q96A32	169 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	CCDC154	A6NI56	674 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	UBD	O15205	165 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	CRTAM	O95727	393 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ERVK-10	P10266	1014 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	HPCAL1	P37235	193 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	PNPLA4	P41247	253 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	AKR1D1	P51857	326 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ARF5	P84085	180 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	CCNI	Q14094	377 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ADSSL1	Q8N142	457 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF614	Q8N883	585 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	MET	P08581	1390 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ECE2	O60344	883 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	WFS1	O76024	890 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	PRKCB	P05771	671 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	PIK3CG	P48736	1102 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	SIK1	P57059	783 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	PDPR	Q8NCN5	879 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	13.67	□□□□□ -0.22	1e-6	■■■■□ 23.5
NCOR2-208	ENST00000429285	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	NLRP1	Q9C000	1473 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ZBTB22	O15209	634 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	LARGE1	O95461	756 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	KCNB2	Q92953	911 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	REPS1	Q96D71	796 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	GYPC	P04921	128 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	HSF2	Q03933	536 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	GPAM	Q9HCL2	828 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	FOSL2	P15408	326 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	USP21	Q9UK80	565 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	PRRG1	O14668	218 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NCOR2-208	ENST00000429285	TC2N	Q8N9U0	490 aa		13.66	□□□□□ -0.22

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