RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF212Q9UDV6 495 aa22.21■■□□□ 1.15
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PTDSS1-201ENST00000337004 WASHC5Q12768 1159 aa22.2■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 DBN1Q16643 649 aa22.2■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 Q3C1V9 767 aa22.2■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.2■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 C6orf163Q5TEZ5 329 aa22.2■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.2■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 NRG4Q8WWG1 115 aa22.2■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.2■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.2■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 LRCH1Q9Y2L9 728 aa22.2■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.2■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 RCN2Q14257 317 aa22.2■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAL1Q4LDG9 190 aa22.2■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 DTX3LQ8TDB6 740 aa22.2■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 SIKE1Q9BRV8 207 aa22.2■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 WDR90Q96KV7 1748 aa22.2■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 TSPAN1O60635 241 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 LGALS2P05162 132 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 SERPINA6P08185 405 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 AP1B1Q10567 949 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 SCUBE1Q8IWY4 988 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 OTUD5Q96G74 571 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 CIB2O75838 187 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 GRIA1P42261 906 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 KDSRQ06136 332 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 LAMC2Q13753 1193 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 IRGCQ6NXR0 463 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 ACMSDQ8TDX5 336 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC106Q9BWC9 280 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 C20orf27Q9GZN8 174 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.19■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 MLNP12872 115 aa22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 FDFT1P37268 417 aa22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 GRM5P41594 1212 aa22.18■■□□□ 1.14
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PTDSS1-201ENST00000337004 CDKL2Q92772 493 aa22.18■■□□□ 1.14
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PTDSS1-201ENST00000337004 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.18■■□□□ 1.14
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PTDSS1-201ENST00000337004 ALDH1A2O94788 518 aa22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 LINGO3P0C6S8 592 aa22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 CASC4Q6P4E1 433 aa22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 HTR3CQ8WXA8 447 aa22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 ATP2A3Q93084 1043 aa22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 ELP3Q9H9T3 547 aa22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa22.18■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 ASB14A6NK59 587 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP3K7O43318 606 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 ARHGAP1Q07960 439 aa22.17■■□□□ 1.14
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PTDSS1-201ENST00000337004 STEAP4Q687X5 459 aa22.17■■□□□ 1.14
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PTDSS1-201ENST00000337004 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC26A9Q7LBE3 791 aa22.17■■□□□ 1.14
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PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 DTLQ9NZJ0 730 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.17■■□□□ 1.14
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PTDSS1-201ENST00000337004 AMPD1P23109 780 aa22.17■■□□□ 1.14
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PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM154Q6P9G4 183 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 C7orf31Q8N865 590 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 C1orf21Q9H246 121 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 VCXQ9H320 206 aa22.17■■□□□ 1.14
PTDSS1-201ENST00000337004 MROH8Q9H579 483 aa22.17■■□□□ 1.14
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