RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333090.4

TSKU-201, Transcript of tsukushi, small leucine rich proteoglycan, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSKU, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKU-201ENST00000333090 SURF1Q15526 300 aa24.38■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 OR6B2Q6IFH4 312 aa24.38■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ZNF534Q76KX8 674 aa24.38■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 HPS6Q86YV9 775 aa24.38■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 DEFB107AQ8IZN7 70 aa24.38■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 CCDC33Q8N5R6 958 aa24.38■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 OPTNQ96CV9 577 aa24.38■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PNPOQ9NVS9 261 aa24.38■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PRKCBP05771 671 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 RAG1P15918 1043 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 MAVSQ7Z434 540 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 SATL1Q86VE3 508 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 NAT14Q8WUY8 206 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ELOVL4Q9GZR5 314 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 EMCNQ9ULC0 261 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 POMPQ9Y244 141 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 SIP14410 1827 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 C2CD4BA6NLJ0 364 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 STK10O94804 968 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 L1CAMP32004 1257 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 GPD2P43304 727 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 CBLBQ13191 982 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 GRAMD1BQ3KR37 738 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PGM2L1Q6PCE3 622 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PCDH19Q8TAB3 1148 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.37■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ZMPSTE24O75844 475 aa24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ADORA2AP29274 412 aa24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 EFNA5P52803 228 aa24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 LSAMPQ13449 338 aa24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PDK3Q15120 406 aa24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 RNF149Q8NC42 400 aa24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 MCUQ8NE86 351 aa24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ACTRT2Q8TDY3 377 aa24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 JADE3Q92613 823 aa24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 F5H423 210 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 MAGEA6P43360 314 aa24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 CNTN2Q02246 1040 aa24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 CASC4Q6P4E1 433 aa24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PPP4R1Q8TF05 950 aa24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.36■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 OR6B1O95007 311 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 SPATA31D3P0C874 917 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 TGM2P21980 687 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 MAGEA3P43357 314 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 IDH3AP50213 366 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PDPK2PQ6A1A2 396 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ATG14Q6ZNE5 492 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 DTNBP1Q96EV8 351 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 TPP1O14773 563 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 FSTL1Q12841 308 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 CA9Q16790 459 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 SPATA24Q86W54 205 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 JDP2Q8WYK2 163 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 BCO2Q9BYV7 579 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 CLIC5Q9NZA1 410 aa24.35■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PGM3O95394 542 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PRKG1Q13976 671 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 GRM2Q14416 872 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 TIFABQ6ZNK6 161 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ILDR2Q71H61 639 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 C10orf107Q8IVU9 208 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 CMTM5Q96DZ9 223 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PCDH18Q9HCL0 1135 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 SIX4Q9UIU6 781 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PLIN3O60664 434 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 CXCL8P10145 99 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 ITGAXP20702 1163 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 CRADDP78560 199 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 PDK2Q15119 407 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 FBXL19Q6PCT2 694 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 FRMD7Q6ZUT3 714 aa24.34■■□□□ 1.49
TSKU-201ENST00000333090 REPS2Q8NFH8 660 aa24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms