RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520036.1

ACTBP6-201, Transcript of actin, beta pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP6, Length 1,090 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP6-201ENST00000520036 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 IGSF9Q9P2J2 1179 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 TJP2Q9UDY2 1190 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 C2orf78A6NCI8 922 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 PIK3R2O00459 728 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 IRAK2O43187 625 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 ECI2O75521 394 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 IGLV3-27P01718 113 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 APOEP02649 317 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 FYNP06241 537 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 MSNP26038 577 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 RDXP35241 583 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 PCK1P35558 622 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 NTHL1P78549 312 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 CYP4F8P98187 520 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 TXNDC8Q6A555 127 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 HTR3DQ70Z44 454 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 BNIPLQ7Z465 357 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 ADHFE1Q8IWW8 467 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 SYCE1Q8N0S2 351 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 RXFP2Q8WXD0 754 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 EDEM1Q92611 657 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 BTN2A3PQ96KV6 586 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 APOL5Q9BWW9 433 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 DDIT4Q9NX09 232 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 OSER1Q9NX31 292 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 MYO1AQ9UBC5 1043 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 ANHXE9PGG2 379 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 M0QYT0 321 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 HTR7P34969 479 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 CHKAP35790 457 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 FLT3P36888 993 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 SLC11A2P49281 568 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 CXCR3P49682 368 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 SULT1E1P49888 294 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 TBX4P57082 545 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 DEUP1Q05D60 604 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 EFEMP1Q12805 493 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 USP4Q13107 963 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 MTF1Q14872 753 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 TAF5Q15542 800 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 CLUL1Q15846 466 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 HADHQ16836 314 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 C2CD6Q53TS8 623 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 SYPL2Q5VXT5 272 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 C11orf63Q6NUN7 778 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 ING5Q8WYH8 240 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 NTAN1Q96AB6 310 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 SLC39A13Q96H72 371 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 MYADMQ96S97 322 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 TBCBQ99426 244 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 KCND1Q9NSA2 647 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 DONSONQ9NYP3 566 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 CPQQ9Y646 472 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 CDH23Q9H251 3354 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 MYH10P35580 1976 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 SLC12A8A0AV02 714 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 GRAP2O75791 330 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 STC2O76061 302 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 PROSCO94903 275 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 PSMC3P17980 439 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 PSMA2P25787 234 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 NOP2P46087 812 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 FCHO2Q0JRZ9 810 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 SCAPQ12770 1279 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 PDGFRLQ15198 375 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 ZNF77Q15935 545 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 CCDC14Q49A88 953 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 BOLA3Q53S33 107 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTBP6-201ENST00000520036 FAM78AQ5JUQ0 283 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms