RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 C10orf120Q5SQS8 335 aa27.75■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 C1orf220Q5T0J3 134 aa27.75■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 RGL4Q8IZJ4 473 aa27.75■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 DNAI2Q9GZS0 605 aa27.75■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 NAGPAQ9UK23 515 aa27.75■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 NUDT5Q9UKK9 219 aa27.75■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF510Q9Y2H8 683 aa27.75■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 FAM221BA6H8Z2 402 aa27.74■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 CALUO43852 315 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 STC2O76061 302 aa27.74■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 GNSP15586 552 aa27.74■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF132P52740 706 aa27.74■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF423Q2M1K9 1284 aa27.74■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 PLEKHG6Q3KR16 790 aa27.74■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC186Q7Z3E2 898 aa27.74■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 ERLEC1Q96DZ1 483 aa27.74■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 SLC6A17Q9H1V8 727 aa27.74■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 CD93Q9NPY3 652 aa27.74■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 CLIC5Q9NZA1 410 aa27.74■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa27.74■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 NPC1O15118 1278 aa27.73■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 MYL1P05976 194 aa27.73■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 VAMP7P51809 220 aa27.73■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 STARD3Q14849 445 aa27.73■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 WDR45BQ5MNZ6 344 aa27.73■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 OR2I1PQ8NGU4 316 aa27.73■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 BHMTQ93088 406 aa27.73■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 PLK2Q9NYY3 685 aa27.73■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa27.73■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 STON1Q9Y6Q2 735 aa27.73■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 CACNA1EQ15878 2313 aa27.73■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 WASH3PC4AMC7 463 aa27.72■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 KIF20AO95235 890 aa27.72■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 PENKP01210 267 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 RALAP11233 206 aa27.72■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 CD6P30203 668 aa27.72■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 CHKAP35790 457 aa27.72■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 FAM193AP78312 1265 aa27.72■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 SCD5Q86SK9 330 aa27.72■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 SNX21Q969T3 373 aa27.72■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 NIF3L1Q9GZT8 377 aa27.72■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 USP3Q9Y6I4 520 aa27.72■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 CILPO75339 1184 aa27.71■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 GJB3O75712 270 aa27.71■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 COG7P83436 770 aa27.71■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 FUT11Q495W5 492 aa27.71■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 DUSP16Q9BY84 665 aa27.71■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 DCLK3Q9C098 648 aa27.71■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa27.71■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa27.71■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 USP25Q9UHP3 1055 aa27.71■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 RCOR1Q9UKL0 485 aa27.71■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa27.71■■■□□ 2.03
PBRM1-218ENST00000458294 MFAP3P55082 362 aa27.7■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 ENPEPQ07075 957 aa27.7■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 E2F5Q15329 346 aa27.7■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 NFIL3Q16649 462 aa27.7■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 FYB2Q5VWT5 728 aa27.7■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 TAS1R2Q8TE23 839 aa27.7■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 UCMAQ8WVF2 138 aa27.7■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 P2RY11Q96G91 374 aa27.7■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 KLKB1P03952 638 aa27.69■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 CD58P19256 250 aa27.69■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 GCLMP48507 274 aa27.69■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 ENPP2Q13822 863 aa27.69■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa27.69■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC150Q8NCX0 1101 aa27.69■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 DNASE2BQ8WZ79 361 aa27.69■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 ITM2CQ9NQX7 267 aa27.69■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 RASAL2Q9UJF2 1139 aa27.69■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 SH3BP5O60239 455 aa27.68■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 TRIM49P0CI25 452 aa27.68■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 TRIM49CP0CI26 452 aa27.68■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 NR2F2P24468 414 aa27.68■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 PPP3CAQ08209 521 aa27.68■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 GEN1Q17RS7 908 aa27.68■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 CADM4Q8NFZ8 388 aa27.68■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa27.68■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1B0GTW7 788 aa27.67■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 MEI4A8MW99 385 aa27.67■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 KRT13P13646 458 aa27.67■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 PFKFB1P16118 471 aa27.67■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 MAOBP27338 520 aa27.67■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 IL12RB1P42701 662 aa27.67■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 GRIK2Q13002 908 aa27.67■■■□□ 2.02
PBRM1-218ENST00000458294 NAXDQ8IW45 347 aa27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms