RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	DGAT1	O75907	488 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	KRT37	O76014	449 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	PROC	P04070	461 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	ITGAV	P06756	1048 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	RGS7	P49802	495 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	ROR1	Q01973	937 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	DEUP1	Q05D60	604 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	ERO1B	Q86YB8	467 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	RELL1	Q8IUW5	271 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	GINS2	Q9Y248	185 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	SBF1	O95248	1867 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	TRPA1	O75762	1119 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	KDELR1	P24390	212 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	PEX2	P28328	305 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	KRT81	Q14533	505 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF699	Q32M78	642 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	CES4A	Q5XG92	561 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	PGBD4	Q96DM1	585 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	MOCOS	Q96EN8	888 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	GCNA	Q96QF7	691 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	ASB3	Q9Y575	518 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	LCT	P09848	1927 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	SOCS7	O14512	581 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	DGKI	O75912	1065 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	SPATA31D3	P0C874	917 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	MIP	P30301	263 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	GRIA1	P42261	906 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	CLCN3	P51790	818 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	PDE1B	Q01064	536 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	HIC1	Q14526	733 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	PSMD6	Q15008	389 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	XKR3	Q5GH77	459 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	PCGF5	Q86SE9	256 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	FBXL18	Q96ME1	805 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	WWP1	Q9H0M0	922 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	CFLAR	O15519	480 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	B4GALT5	O43286	388 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	SAT1	P21673	171 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	GART	P22102	1010 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	STX3	Q13277	289 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	MMEL1	Q495T6	779 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	CES3	Q6UWW8	571 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	CHST13	Q8NET6	341 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	SPATA33	Q96N06	139 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	PHF12	Q96QT6	1004 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	TLE6	Q9H808	572 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC78	A2IDD5	438 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	ZBED1	O96006	694 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	RBL1	P28749	1068 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	AQP4	P55087	323 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	CAPS	Q13938	189 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	KCTD2	Q14681	263 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	SATL1	Q86VE3	508 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	RNF149	Q8NC42	400 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	CPXM1	Q96SM3	734 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	NDN	Q99608	321 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	WDR81	Q562E7	1941 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPIN3-222	ENST00000639482	ITM2A	O43736	263 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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