RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592393.5

BCAS3-228, Transcript of BCAS3, microtubule associated cell migration factor, human

TSL 5

Gene BCAS3, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BCAS3-228	ENST00000592393	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	COASY	Q13057	564 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	SP140	Q13342	867 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	LGI4	Q8N135	537 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	LMF1	Q96S06	567 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	MYOC	Q99972	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	MYO10	Q9HD67	2058 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	FRYL	O94915	3013 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	TET1	Q8NFU7	2136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	F2RL2	O00254	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	KPNA5	O15131	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	STRN	O43815	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	NOBOX	O60393	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	C1QL1	O75973	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	STC2	O76061	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	AHSG	P02765	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	CYP2C9	P11712	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	MYF5	P13349	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	BRAF	P15056	766 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	PRDX5	P30044	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	NDUFV1	P49821	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	NOMO3	P69849	1222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	CFHR4	Q92496	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	APIP	Q96GX9	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	PANK3	Q9H999	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	DOCK2	Q92608	1830 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	SPTA1	P02549	2419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	MATN2	O00339	956 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	CTAGE5	O15320	804 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	PPP2CB	P62714	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	PPP2CA	P67775	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	ADAM8	P78325	824 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BCAS3-228	ENST00000592393	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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