RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578446.1

USP22-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 3

Gene USP22, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-208	ENST00000578446	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PDGFRA	P16234	1089 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PFKL	P17858	780 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	HDC	P19113	662 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	GPD1	P21695	349 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	NOS2	P35228	1153 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	AVPR1A	P37288	418 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SULT1E1	P49888	294 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	EFEMP1	Q12805	493 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TAC4	Q86UU9	113 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TTC16	Q8NEE8	873 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ADAM32	Q8TC27	787 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	FGF13	Q92913	245 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SERPINB11	Q96P15	392 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TASP1	Q9H6P5	420 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	DDIT4	Q9NX09	232 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	RRN3	Q9NYV6	651 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	CDH7	Q9ULB5	785 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	FAM50B	Q9Y247	325 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	RCCD1	A6NED2	376 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SOBP	A7XYQ1	873 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446		M0QYT0	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	DPYSL4	O14531	572 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ZSCAN12	O43309	604 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	OLFM2	O95897	454 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PSMA2	P25787	234 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ATP11A	P98196	1134 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	NME3	Q13232	169 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	CDO1	Q16878	200 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TRNP1	Q6NT89	227 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ZNF276	Q8N554	614 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SLC22A12	Q96S37	553 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	CNPY3	Q9BT09	278 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TRIM7	Q9C029	511 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	GDE1	Q9NZC3	331 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	COX16	Q9P0S2	106 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	THEG	Q9P2T0	379 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	MYH10	P35580	1976 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446		A0A0U1RQJ8	604 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SLC12A8	A0AV02	714 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	MYO1F	O00160	1098 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PJA2	O43164	708 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	CCP110	O43303	1012 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	KRT86	O43790	486 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	MTA2	O94776	668 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	HMBS	P08397	361 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	IRF1	P10914	325 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	GBP1	P32455	592 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PTPN9	P43378	593 aa		11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
USP22-208	ENST00000578446	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63

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