RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	SIX4	Q9UIU6	781 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	CDH9	Q9ULB4	789 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298		K7ENM7	598 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	TSPAN3	O60637	253 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	GLDC	P23378	1020 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	DGKG	P49619	791 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	PGF	P49763	221 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	ZNF131	P52739	623 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	UCN	P55089	124 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	GTF2B	Q00403	316 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	TEAD4	Q15561	434 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	ME3	Q16798	604 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	HTR3D	Q70Z44	454 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	FAM124A	Q86V42	546 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	REEP2	Q9BRK0	252 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	BBS2	Q9BXC9	721 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	EHD2	Q9NZN4	543 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	MYH11	P35749	1972 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	NUMA1	Q14980	2115 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	WNT1	P04628	370 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	PLA2G4B	P0C869	781 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	IRF1	P10914	325 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	ANXA13	P27216	316 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	ZNF132	P52740	706 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	CYP27A1	Q02318	531 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	VAC14	Q08AM6	782 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	ST3GAL1	Q11201	340 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	ORC1	Q13415	861 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	STARD3	Q14849	445 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	INAVA	Q3KP66	663 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	CACUL1	Q86Y37	369 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	EID2	Q8N6I1	236 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	EXD3	Q8N9H8	876 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	GTF3C6	Q969F1	213 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	KCND2	Q9NZV8	630 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-208	ENST00000547298	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	DFNA5	O60443	496 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	IL18RAP	O95256	599 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	PRKCH	P24723	683 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	CD27	P26842	260 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	YWHAQ	P27348	245 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	TUB	P50607	506 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	HECTD3	Q5T447	861 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	BROX	Q5VW32	411 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	DPH6	Q7L8W6	267 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	PLIN2	Q99541	437 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	PLK2	Q9NYY3	685 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	IL37	Q9NZH6	218 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298		K7ENP7	123 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	VILL	O15195	856 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	KLK10	O43240	276 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	REC8	O95072	547 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	SCP2	P22307	547 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	MFAP3	P55082	362 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	NFATC3	Q12968	1075 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	ILK	Q13418	452 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	TRIM29	Q14134	588 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	ZNF234	Q14588	700 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-208	ENST00000547298	NUP93	Q8N1F7	819 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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