RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 PEX3P56589 373 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 PFKPQ01813 784 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 EMC2Q15006 297 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 DHDDSQ86SQ9 333 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM143Q96AN5 459 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SNF8Q96H20 258 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 PARVGQ9HBI0 331 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SELENONQ9NZV5 590 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFA13Q9P0J0 144 aa10.48□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 C14orf80Q86SX3 495 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 C7orf61Q8IZ16 206 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 PPM1KQ8N3J5 372 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 RNF149Q8NC42 400 aa10.48□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 HDAC4P56524 1084 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 CDK16Q00536 496 aa10.48□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 CD300CQ08708 224 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa10.48□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 CCDC110Q8TBZ0 833 aa10.48□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 C2orf40Q9H1Z8 148 aa10.48□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 PDE1BQ01064 536 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TLE2Q04725 743 aa10.48□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 SLC20A1Q8WUM9 679 aa10.48□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 ARPC5LQ9BPX5 153 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 RNPEPQ9H4A4 650 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TBCCD1Q9NVR7 557 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 MTUS1Q9ULD2 1270 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF148Q9UQR1 794 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TMED5Q9Y3A6 229 aa10.48□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 SMUG1Q53HV7 270 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SGO2Q562F6 1265 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM199Q8N511 208 aa10.47□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 DNAJB3Q8WWF6 145 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SYT11Q9BT88 431 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM55Q9BYV6 548 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SLC17A7Q9P2U7 560 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SFI1A8K8P3 1242 aa10.47□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 DLDP09622 509 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
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