RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484281.1

RAB18-205, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB18, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-205	ENST00000484281	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	KRT17	Q04695	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	LMAN2	Q12907	356 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	FOXE3	Q13461	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	BIRC2	Q13490	618 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	TESK1	Q15569	626 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	DGKD	Q16760	1214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	NAXD	Q8IW45	347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281		Q8TCH9	128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	FGF13	Q92913	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CFAP53	Q96M91	514 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CASD1	Q96PB1	797 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	RYR1	P21817	5038 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	OPHN1	O60890	802 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ZBED4	O75132	1171 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	RHOBTB1	O94844	696 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	TPM3	P06753	285 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	LDHC	P07864	332 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CTSA	P10619	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	STAT5A	P42229	794 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SOX9	P48436	509 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SNAP25	P60880	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	GSTO1	P78417	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	MAPK6	Q16659	721 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	MOCOS	Q96EN8	888 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF558	Q96NG5	402 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	PI4KA	P42356	2102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	ACAN	P16112	2415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	C22orf46	C9J442	243 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	GRM8	O00222	908 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	BRINP1	O60477	761 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAB18-205	ENST00000484281	GH1	P01241	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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