RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026296.7

Fgd1-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Fgd1, Length 4,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mcm9Q2KHI9 1134 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Pih1d3Q3KNI6 218 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gtse1Q8R080 741 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 HnmtQ91VF2 295 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mov10l1Q99MV5 1187 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Greb1lB9EJV3 1913 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Pex10B1AUE5 324 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Vmn2r104E9Q2J5 860 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tmigd3G3X8R9 209 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cyp2b9P12790 491 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 MafbP54841 323 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cyp2c39P56656 490 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Crnkl1P63154 690 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Grb7Q03160 535 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Zbtb14Q08376 449 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ttc9Q3V038 219 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cage1Q5IR70 849 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cd37Q61470 281 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Npdc1Q64322 332 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Acap2Q6ZQK5 770 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Rps6kc1Q8BLK9 1056 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Fndc3aQ8BX90 1198 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tp53inp2Q8CFU8 221 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Rassf9Q8K342 435 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Dok4Q99KE3 325 aa14.92□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tnfrsf18O35714 228 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tespa1Q3U132 458 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Q3UE31 404 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Fnip2Q80TD3 1108 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Polr2eQ80UW8 210 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Q80WR5 230 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gxylt2Q810K9 444 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Frmd4aQ8BIE6 1020 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 SowahaQ8BLS7 548 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ttc39bQ8BYY4 617 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Snap47Q8R570 413 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Plekha4Q8VC98 588 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Kdm4bQ91VY5 1086 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Dpp3Q99KK7 738 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Hars2Q99KK9 505 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ing2Q9ESK4 281 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Kifc5bE9PUA5 672 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gm10250G3X9L6 160 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 JchainP01592 159 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tex11Q14AT2 947 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Nr2c1Q505F1 590 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Il33Q8BVZ5 266 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Zcchc18Q8VD24 393 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Olfr1352Q8VGX5 309 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Rxfp2Q91ZZ5 737 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Sntg2Q925E0 539 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Bzw1Q9CQC6 419 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Nde1Q9CZA6 344 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Atp5hQ9DCX2 161 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Kat2bQ9JHD1 813 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 PolkQ9QUG2 852 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Olfr611K7N609 323 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Olfr612L7N462 323 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cyp2b10P12791 500 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ass1P16460 412 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 PcnaP17918 261 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 IppP28575 584 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tubgcp3P58854 905 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mif4gdQ3UBZ5 222 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mapk15Q80Y86 549 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Slc15a5Q8CBB2 566 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Abi1Q8CBW3 481 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Znf426Q8R1D1 550 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 NcaldQ91X97 193 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ccdc22Q9JIG7 627 aa14.91□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gm6133B2RY53 190 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Arl14Q3SXC5 192 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Spag6Q3V0U9 509 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Sp140Q6NSQ5 534 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Rad9bQ6WBX7 403 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Prmt7Q922X9 692 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Adgrf4Q9D2L6 698 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Celf2Q9Z0H4 508 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mbd1Q9Z2E2 636 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cacna1sQ02789 1880 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gm4302E9PX25 294 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Lrfn2Q80TG9 788 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 HomezQ80W88 542 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Zfp120Q8BZW4 436 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Pak5Q8C015 719 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Fcho1Q8K285 873 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Olfr356Q8VFP5 315 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tmem68Q9D850 329 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tekt1Q9DAJ2 418 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Spag17Q5S003 2320 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Plekhg4A0A1L1SU27 1217 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gm27029A2A4P4 543 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gm5930D3Z257 264 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Clca3bE9PUL3 1044 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gm3402K7N5P2 326 aa14.9□□□□□ -0.02
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Fgfr2P21803 821 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.9 ms