RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W YLR307C-AQ3E825 87 aa3.13□□□□□ -1.91
YMR196WYMR196W YEL014CP39999 101 aa3.12□□□□□ -1.91
YMR196WYMR196W HUB1Q6Q546 73 aa3.1□□□□□ -1.91
YMR196WYMR196W Q0032Q9ZZX7 96 aa3.1□□□□□ -1.91
YMR196WYMR196W YDR034C-AP0C289 58 aa3.1□□□□□ -1.91
YMR196WYMR196W YGL041C-BQ3E750 60 aa3.1□□□□□ -1.91
YMR196WYMR196W YBR230W-AQ3E762 66 aa3.1□□□□□ -1.91
YMR196WYMR196W ATP17Q06405 101 aa3.09□□□□□ -1.91
YMR196WYMR196W YJR107C-AP0CT86 78 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR196WYMR196W YJL127C-BQ3E828 52 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR196WYMR196W YDR210WQ03482 75 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR196WYMR196W YAL067W-AQ8TGK6 75 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR196WYMR196W COX8P04039 78 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR196WYMR196W YFL067WP43537 175 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR196WYMR196W LCL2Q08045 131 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR196WYMR196W RPL38P49167 78 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YMR196WYMR196W ATP18P81450 59 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR196WYMR196W YFR009W-AP0C5M9 85 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR196WYMR196W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.04□□□□□ -1.92not detected
YMR196WYMR196W YGL014C-AP0C5N1 53 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR196WYMR196W YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
YMR196WYMR196W DDR2P89113 61 aa3.02□□□□□ -1.93
YMR196WYMR196W YIL102CP40488 101 aa3.02□□□□□ -1.93
YMR196WYMR196W YMR001C-AQ8TGS9 76 aa3.02□□□□□ -1.93
YMR196WYMR196W YLR157W-DP0CE99 70 aa3.01□□□□□ -1.93
YMR196WYMR196W YHR007C-AQ07074 71 aa3□□□□□ -1.93
YMR196WYMR196W SDH6Q3E785 79 aa2.99□□□□□ -1.93
YMR196WYMR196W YOR072WQ08486 104 aa2.99□□□□□ -1.93
YMR196WYMR196W LCL1Q02786 101 aa2.99□□□□□ -1.93
YMR196WYMR196W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa2.97□□□□□ -1.93
YMR196WYMR196W YHR213W-BQ8TGK1 99 aa2.97□□□□□ -1.93
YMR196WYMR196W YJL133C-AQ3E7A3 74 aa2.95□□□□□ -1.94
YMR196WYMR196W YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
YMR196WYMR196W YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa2.92□□□□□ -1.94
YMR196WYMR196W YLR255CO13574 117 aa2.91□□□□□ -1.94
YMR196WYMR196W YDL012CQ12489 107 aa2.9□□□□□ -1.94
YMR196WYMR196W YJL144WP47009 104 aa2.9□□□□□ -1.95
YMR196WYMR196W YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa2.9□□□□□ -1.95
YMR196WYMR196W YAR064WP39563 99 aa2.83□□□□□ -1.96
YMR196WYMR196W COX7P10174 60 aa2.78□□□□□ -1.97
YMR196WYMR196W YJR128WP47162 119 aa2.76□□□□□ -1.97
YMR196WYMR196W YHR073W-AP0C5N7 58 aa2.76□□□□□ -1.97
YMR196WYMR196W YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa2.74□□□□□ -1.97
YMR196WYMR196W YOR316C-AQ3E806 69 aa2.71□□□□□ -1.98
YMR196WYMR196W YJL009WP47078 108 aa2.69□□□□□ -1.98
YMR196WYMR196W YGR146C-AQ8TGT9 53 aa2.65□□□□□ -1.99
YMR196WYMR196W OLI1P61829 76 aa2.64□□□□□ -1.99
YMR196WYMR196W YCR108CQ3E819 63 aa2.62□□□□□ -1.99
YMR196WYMR196W YBR016WP38216 128 aa2.6□□□□□ -1.99
YMR196WYMR196W YBL044WP38194 122 aa2.58□□□□□ -2
YMR196WYMR196W RPL37BP51402 88 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
YMR196WYMR196W Q0017Q9ZZX8 53 aa2.47□□□□□ -2.01
YMR196WYMR196W YBR072C-AQ3E794 53 aa2.46□□□□□ -2.02
YMR196WYMR196W HHY1P39982 102 aa2.45□□□□□ -2.02
YMR196WYMR196W YHR086W-AQ3E746 53 aa2.44□□□□□ -2.02
YMR196WYMR196W YML054C-AQ3E809 52 aa2.34□□□□□ -2.03
YMR196WYMR196W RPL37AP49166 88 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
YMR196WYMR196W YOR072W-BQ3E832 53 aa2.27□□□□□ -2.05
YMR196WYMR196W YOL164W-AQ3E7A5 60 aa2.23□□□□□ -2.05
YMR196WYMR196W YLR157W-EP0CF00 54 aa2.07□□□□□ -2.08
YMR196WYMR196W RPS29BP41058 56 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
YMR196WYMR196W RPS29AP41057 56 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
YMR196WYMR196W YHR050W-AQ05451 56 aa1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 52.1 ms