RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		2.25	□□□□□ -2.05
RPS1B	YML063W	YNL198C	P40166	100 aa		2.23	□□□□□ -2.05
RPS1B	YML063W	ATP18	P81450	59 aa		2.23	□□□□□ -2.05
RPS1B	YML063W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		2.23	□□□□□ -2.05
RPS1B	YML063W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		2.22	□□□□□ -2.05
RPS1B	YML063W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		2.22	□□□□□ -2.05
RPS1B	YML063W	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		2.21	□□□□□ -2.06
RPS1B	YML063W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		2.21	□□□□□ -2.06
RPS1B	YML063W	COX7	P10174	60 aa		2.2	□□□□□ -2.06
RPS1B	YML063W	YSY6	P38374	65 aa		2.2	□□□□□ -2.06
RPS1B	YML063W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		2.2	□□□□□ -2.06
RPS1B	YML063W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		2.19	□□□□□ -2.06
RPS1B	YML063W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
RPS1B	YML063W	SDH6	Q3E785	79 aa		2.17	□□□□□ -2.06
RPS1B	YML063W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		2.16	□□□□□ -2.06
RPS1B	YML063W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
RPS1B	YML063W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		2.15	□□□□□ -2.07
RPS1B	YML063W	ATP17	Q06405	101 aa		2.15	□□□□□ -2.07
RPS1B	YML063W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		2.15	□□□□□ -2.07
RPS1B	YML063W	PMP3	P87284	55 aa		2.14	□□□□□ -2.07
RPS1B	YML063W	RPC10	P40422	70 aa		2.13	□□□□□ -2.07
RPS1B	YML063W	HUB1	Q6Q546	73 aa		2.13	□□□□□ -2.07
RPS1B	YML063W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		2.11	□□□□□ -2.07
RPS1B	YML063W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		2.11	□□□□□ -2.07
RPS1B	YML063W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		2.1	□□□□□ -2.07
RPS1B	YML063W	YNL190W	P53872	204 aa		2.09	□□□□□ -2.07
RPS1B	YML063W	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		2.09	□□□□□ -2.07
RPS1B	YML063W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		2.06	□□□□□ -2.08
RPS1B	YML063W	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	2.03	□□□□□ -2.08
RPS1B	YML063W	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	2.03	□□□□□ -2.08
RPS1B	YML063W	TOS6	P48560	102 aa		2.03	□□□□□ -2.08
RPS1B	YML063W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		2.03	□□□□□ -2.08
RPS1B	YML063W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		2.01	□□□□□ -2.09
RPS1B	YML063W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	2	□□□□□ -2.09
RPS1B	YML063W	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		1.98	□□□□□ -2.09
RPS1B	YML063W	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		1.98	□□□□□ -2.09
RPS1B	YML063W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	1.97	□□□□□ -2.09
RPS1B	YML063W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		1.96	□□□□□ -2.1
RPS1B	YML063W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		1.96	□□□□□ -2.1
RPS1B	YML063W	OLI1	P61829	76 aa		1.92	□□□□□ -2.1
RPS1B	YML063W	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		1.92	□□□□□ -2.1
RPS1B	YML063W	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		1.91	□□□□□ -2.1
RPS1B	YML063W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	1.9	□□□□□ -2.11
RPS1B	YML063W	DDR2	P89113	61 aa		1.89	□□□□□ -2.11
RPS1B	YML063W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		1.89	□□□□□ -2.11
RPS1B	YML063W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		1.88	□□□□□ -2.11
RPS1B	YML063W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	1.88	□□□□□ -2.11
RPS1B	YML063W	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		1.87	□□□□□ -2.11
RPS1B	YML063W	YOR394C-A	Q8TGJ0	55 aa		1.87	□□□□□ -2.11
RPS1B	YML063W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		1.84	□□□□□ -2.11
RPS1B	YML063W	YBR016W	P38216	128 aa		1.78	□□□□□ -2.12
RPS1B	YML063W	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		1.71	□□□□□ -2.14
RPS1B	YML063W	YBL044W	P38194	122 aa		1.7	□□□□□ -2.14
RPS1B	YML063W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	1.68	□□□□□ -2.14
RPS1B	YML063W	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		1.64	□□□□□ -2.15
RPS1B	YML063W	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		1.62	□□□□□ -2.15
RPS1B	YML063W	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		1.62	□□□□□ -2.15
RPS1B	YML063W	YGR146C-A	Q8TGT9	53 aa		1.58	□□□□□ -2.16
RPS1B	YML063W	YCR108C	Q3E819	63 aa		1.56	□□□□□ -2.16
RPS1B	YML063W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	1.45	□□□□□ -2.18
RPS1B	YML063W	YML054C-A	Q3E809	52 aa		1.43	□□□□□ -2.18
RPS1B	YML063W	YOR072W-B	Q3E832	53 aa		1.38	□□□□□ -2.19
RPS1B	YML063W	YHR050W-A	Q05451	56 aa		1	□□□□□ -2.25

Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.5 ms