RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa3.13□□□□□ -1.91
RRP4YHR069C YIL102CP40488 101 aa3.12□□□□□ -1.91
RRP4YHR069C YJL144WP47009 104 aa3.12□□□□□ -1.91
RRP4YHR069C YLR255CO13574 117 aa3.09□□□□□ -1.91
RRP4YHR069C HHF1P02309 103 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RRP4YHR069C YGR146C-AQ8TGT9 53 aa3.08□□□□□ -1.92
RRP4YHR069C AIM4P38305 123 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RRP4YHR069C YHR125WP38831 101 aa3.07□□□□□ -1.92
RRP4YHR069C YDR182W-AQ3E796 67 aa3.06□□□□□ -1.92
RRP4YHR069C YBR016WP38216 128 aa3.05□□□□□ -1.92
RRP4YHR069C FYV12Q08559 129 aa3.05□□□□□ -1.92
RRP4YHR069C YKL065W-AQ2V2P2 73 aa3.03□□□□□ -1.92
RRP4YHR069C YER078W-AQ3E7A2 54 aa3.03□□□□□ -1.92
RRP4YHR069C YBL008W-AQ3E821 79 aa3.03□□□□□ -1.92
RRP4YHR069C Q0017Q9ZZX8 53 aa3.03□□□□□ -1.92
RRP4YHR069C COX8P04039 78 aa3.02□□□□□ -1.93
RRP4YHR069C TOM6P33448 61 aa3.02□□□□□ -1.93
RRP4YHR069C RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RRP4YHR069C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RRP4YHR069C YJL009WP47078 108 aa2.99□□□□□ -1.93
RRP4YHR069C RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RRP4YHR069C RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RRP4YHR069C SBH1P52870 82 aa2.98□□□□□ -1.93
RRP4YHR069C YFR032C-BQ8TGU2 87 aa2.98□□□□□ -1.93
RRP4YHR069C OLI1P61829 76 aa2.94□□□□□ -1.94
RRP4YHR069C YIL156W-BQ2V2P4 73 aa2.94□□□□□ -1.94
RRP4YHR069C SDH6Q3E785 79 aa2.94□□□□□ -1.94
RRP4YHR069C YDR210WQ03482 75 aa2.93□□□□□ -1.94
RRP4YHR069C YGL034CP53186 121 aa2.92□□□□□ -1.94
RRP4YHR069C YLR412C-AQ3E742 68 aa2.9□□□□□ -1.95
RRP4YHR069C OST5Q92316 86 aa2.9□□□□□ -1.95
RRP4YHR069C YMR001C-AQ8TGS9 76 aa2.89□□□□□ -1.95
RRP4YHR069C MRX7P53869 86 aa2.88□□□□□ -1.95
RRP4YHR069C YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa2.88□□□□□ -1.95
RRP4YHR069C YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa2.86□□□□□ -1.95
RRP4YHR069C YBL044WP38194 122 aa2.84□□□□□ -1.95
RRP4YHR069C HUB1Q6Q546 73 aa2.82□□□□□ -1.96
RRP4YHR069C YML054C-AQ3E809 52 aa2.81□□□□□ -1.96
RRP4YHR069C YOR381W-AQ3E804 55 aa2.77□□□□□ -1.97
RRP4YHR069C YMR122CQ03879 124 aa2.75□□□□□ -1.97
RRP4YHR069C YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa2.72□□□□□ -1.97
RRP4YHR069C YOR376W-AQ3E805 51 aa2.71□□□□□ -1.98
RRP4YHR069C YAL067W-AQ8TGK6 75 aa2.71□□□□□ -1.98
RRP4YHR069C YML100W-AQ8TGT0 57 aa2.68□□□□□ -1.98
RRP4YHR069C YER188C-AP0C0V2 99 aa2.67□□□□□ -1.98
RRP4YHR069C ATP17Q06405 101 aa2.67□□□□□ -1.98
RRP4YHR069C YCR095W-AQ3E787 52 aa2.65□□□□□ -1.99
RRP4YHR069C YHR032W-AP0C5N6 59 aa2.61□□□□□ -1.99
RRP4YHR069C RPL37AP49166 88 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RRP4YHR069C YCR108CQ3E819 63 aa2.61□□□□□ -1.99
RRP4YHR069C QCR10P37299 77 aa2.56□□□□□ -2
RRP4YHR069C YEL014CP39999 101 aa2.53□□□□□ -2
RRP4YHR069C RPS29BP41058 56 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
RRP4YHR069C SOM1Q05676 74 aa2.51□□□□□ -2.01
RRP4YHR069C RPS29AP41057 56 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RRP4YHR069C YGL014C-AP0C5N1 53 aa2.43□□□□□ -2.02
RRP4YHR069C YOR072W-BQ3E832 53 aa2.43□□□□□ -2.02
RRP4YHR069C HHY1P39982 102 aa2.29□□□□□ -2.04
RRP4YHR069C YBR072C-AQ3E794 53 aa2.19□□□□□ -2.06
RRP4YHR069C YHR086W-AQ3E746 53 aa2.12□□□□□ -2.07
RRP4YHR069C YHR050W-AQ05451 56 aa2□□□□□ -2.09
RRP4YHR069C YOL164W-AQ3E7A5 60 aa1.8□□□□□ -2.12
RRP4YHR069C YLR157W-EP0CF00 54 aa1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 5.2 ms