RNA–Protein interactions for RNA: YHL028W

WSC4, Transcript of Endoplasmic reticulum (ER) membrane protein, yeast

Gene WSC4, Length 1,818 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WSC4	YHL028W	HUB1	Q6Q546	73 aa		5.04	□□□□□ -1.6
WSC4	YHL028W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		5.04	□□□□□ -1.6
WSC4	YHL028W	YCR043C	P25361	127 aa		5.04	□□□□□ -1.6
WSC4	YHL028W	YBR027C	P38220	110 aa		5.02	□□□□□ -1.61
WSC4	YHL028W	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		5.02	□□□□□ -1.61
WSC4	YHL028W	YDL012C	Q12489	107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WSC4	YHL028W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WSC4	YHL028W	SPG1	P50088	95 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WSC4	YHL028W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WSC4	YHL028W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
WSC4	YHL028W	LCL1	Q02786	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
WSC4	YHL028W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
WSC4	YHL028W	YGL034C	P53186	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
WSC4	YHL028W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.9	□□□□□ -1.62
WSC4	YHL028W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
WSC4	YHL028W	YGL149W	P53116	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WSC4	YHL028W	YJR128W	P47162	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WSC4	YHL028W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WSC4	YHL028W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WSC4	YHL028W	ATP17	Q06405	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WSC4	YHL028W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
WSC4	YHL028W	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		4.81	□□□□□ -1.64
WSC4	YHL028W	YGR146C-A	Q8TGT9	53 aa		4.81	□□□□□ -1.64
WSC4	YHL028W	YLR255C	O13574	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
WSC4	YHL028W	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		4.76	□□□□□ -1.65
WSC4	YHL028W	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		4.75	□□□□□ -1.65
WSC4	YHL028W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.75	□□□□□ -1.65
WSC4	YHL028W	COX8	P04039	78 aa		4.74	□□□□□ -1.65
WSC4	YHL028W	YFL067W	P43537	175 aa		4.68	□□□□□ -1.66
WSC4	YHL028W	MRX7	P53869	86 aa		4.67	□□□□□ -1.66
WSC4	YHL028W	FYV12	Q08559	129 aa		4.65	□□□□□ -1.67
WSC4	YHL028W	OLI1	P61829	76 aa		4.64	□□□□□ -1.67
WSC4	YHL028W	YBR016W	P38216	128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
WSC4	YHL028W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
WSC4	YHL028W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
WSC4	YHL028W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.6	□□□□□ -1.67
WSC4	YHL028W	YJL144W	P47009	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
WSC4	YHL028W	COX7	P10174	60 aa		4.58	□□□□□ -1.68
WSC4	YHL028W	QCR10	P37299	77 aa		4.58	□□□□□ -1.68
WSC4	YHL028W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		4.55	□□□□□ -1.68
WSC4	YHL028W	SOM1	Q05676	74 aa		4.53	□□□□□ -1.68
WSC4	YHL028W	YEL014C	P39999	101 aa		4.49	□□□□□ -1.69
WSC4	YHL028W	YCR108C	Q3E819	63 aa		4.42	□□□□□ -1.7
WSC4	YHL028W	YBL044W	P38194	122 aa		4.37	□□□□□ -1.71
WSC4	YHL028W	YOR394C-A	Q8TGJ0	55 aa		4.37	□□□□□ -1.71
WSC4	YHL028W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		4.3	□□□□□ -1.72
WSC4	YHL028W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.3	□□□□□ -1.72
WSC4	YHL028W	YDR210W	Q03482	75 aa		4.21	□□□□□ -1.74
WSC4	YHL028W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
WSC4	YHL028W	YJL009W	P47078	108 aa		4.14	□□□□□ -1.75
WSC4	YHL028W	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		4.11	□□□□□ -1.75
WSC4	YHL028W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		4.09	□□□□□ -1.76
WSC4	YHL028W	YOR072W-B	Q3E832	53 aa		4.05	□□□□□ -1.76
WSC4	YHL028W	YML054C-A	Q3E809	52 aa		4.04	□□□□□ -1.76
WSC4	YHL028W	HHY1	P39982	102 aa		4	□□□□□ -1.77
WSC4	YHL028W	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		3.98	□□□□□ -1.77
WSC4	YHL028W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		3.94	□□□□□ -1.78
WSC4	YHL028W	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		3.28	□□□□□ -1.88
WSC4	YHL028W	YHR050W-A	Q05451	56 aa		3.22	□□□□□ -1.89
WSC4	YHL028W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.89
WSC4	YHL028W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		3.13	□□□□□ -1.91
WSC4	YHL028W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
WSC4	YHL028W	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		2.79	□□□□□ -1.96

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