RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	-0.05	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YKL044W	P36092	106 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	POP7	P38291	140 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YHR130C	P38834	111 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	SNN1	P48232	102 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YHR050W-A	Q05451	56 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	-0.05	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YOR394C-A	Q8TGJ0	55 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	MOT1	P32333	1867 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	GTT1	P40582	234 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	VMA21	P41806	77 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	HUR1	P45820	110 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	MRX7	P53869	86 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	APS2	Q00381	147 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YCR108C	Q3E819	63 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YOR072W-B	Q3E832	53 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YOR304C-A	O14468	76 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YCR085W	P25650	117 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	SRB6	P32570	121 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	SSS1	P35179	80 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	OLI1	P61829	76 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	ATP18	P81450	59 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	CNL1	Q06333	122 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	TDA2	P40045	126 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	ATP17	Q06405	101 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	OST5	Q92316	86 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	PAI3	P01094	68 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YSY6	P38374	65 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YNL198C	P40166	100 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YOR314W	Q12506	109 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	SDH6	Q3E785	79 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		-0.09	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	ZEO1	Q08245	113 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
RSM27	YGR215W	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
RSM27	YGR215W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
RSM27	YGR215W	HUB1	Q6Q546	73 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
RSM27	YGR215W	SAE3	P89114	91 aa		-0.11	□□□□□ -2.43
RSM27	YGR215W	ATX1	P38636	73 aa		-0.12	□□□□□ -2.43
RSM27	YGR215W	TOM6	P33448	61 aa		-0.13	□□□□□ -2.43
RSM27	YGR215W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		-0.13	□□□□□ -2.43
RSM27	YGR215W	SLO1	Q3E784	85 aa		-0.14	□□□□□ -2.43
RSM27	YGR215W	RUB1	Q03919	77 aa		-0.15	□□□□□ -2.43
RSM27	YGR215W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		-0.17	□□□□□ -2.44

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