RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W YDR182W-AQ3E796 67 aa6.35□□□□□ -1.39
RNQ1YCL028W TOM6P33448 61 aa6.34□□□□□ -1.39
RNQ1YCL028W RPL37BP51402 88 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RNQ1YCL028W YJL144WP47009 104 aa6.29□□□□□ -1.4
RNQ1YCL028W YHR125WP38831 101 aa6.28□□□□□ -1.4
RNQ1YCL028W YGR146C-AQ8TGT9 53 aa6.27□□□□□ -1.41
RNQ1YCL028W YLR255CO13574 117 aa6.23□□□□□ -1.41
RNQ1YCL028W COX8P04039 78 aa6.23□□□□□ -1.41
RNQ1YCL028W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa6.23□□□□□ -1.41
RNQ1YCL028W RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RNQ1YCL028W RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RNQ1YCL028W SDH6Q3E785 79 aa6.17□□□□□ -1.42
RNQ1YCL028W YBL008W-AQ3E821 79 aa6.17□□□□□ -1.42
RNQ1YCL028W YFR032C-BQ8TGU2 87 aa6.17□□□□□ -1.42
RNQ1YCL028W YBR016WP38216 128 aa6.14□□□□□ -1.43
RNQ1YCL028W FYV12Q08559 129 aa6.11□□□□□ -1.43
RNQ1YCL028W Q0017Q9ZZX8 53 aa6.11□□□□□ -1.43
RNQ1YCL028W OLI1P61829 76 aa6.1□□□□□ -1.43
RNQ1YCL028W YIL156W-BQ2V2P4 73 aa6.09□□□□□ -1.43
RNQ1YCL028W OST5Q92316 86 aa6.07□□□□□ -1.44
RNQ1YCL028W YMR001C-AQ8TGS9 76 aa6.03□□□□□ -1.44
RNQ1YCL028W YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa6.02□□□□□ -1.45
RNQ1YCL028W YJL009WP47078 108 aa5.99□□□□□ -1.45
RNQ1YCL028W YGL034CP53186 121 aa5.98□□□□□ -1.45
RNQ1YCL028W MRX7P53869 86 aa5.97□□□□□ -1.45
RNQ1YCL028W HUB1Q6Q546 73 aa5.94□□□□□ -1.46
RNQ1YCL028W YIR021W-AQ3E739 70 aa5.86□□□□□ -1.47
RNQ1YCL028W YDR210WQ03482 75 aa5.81□□□□□ -1.48
RNQ1YCL028W YOR381W-AQ3E804 55 aa5.79□□□□□ -1.48
RNQ1YCL028W YBL044WP38194 122 aa5.78□□□□□ -1.48
RNQ1YCL028W YMR122CQ03879 124 aa5.78□□□□□ -1.48
RNQ1YCL028W YML054C-AQ3E809 52 aa5.77□□□□□ -1.49
RNQ1YCL028W YCR095W-AQ3E787 52 aa5.66□□□□□ -1.5
RNQ1YCL028W YER188C-AP0C0V2 99 aa5.63□□□□□ -1.51
RNQ1YCL028W YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa5.62□□□□□ -1.51
RNQ1YCL028W SBH1P52870 82 aa5.58□□□□□ -1.52
RNQ1YCL028W ATP17Q06405 101 aa5.58□□□□□ -1.52
RNQ1YCL028W YCR108CQ3E819 63 aa5.39□□□□□ -1.55
RNQ1YCL028W YEL014CP39999 101 aa5.38□□□□□ -1.55
RNQ1YCL028W YER175W-AQ8TGU4 54 aa5.36□□□□□ -1.55
RNQ1YCL028W RPL37AP49166 88 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
RNQ1YCL028W YLR412C-AQ3E742 68 aa5.25□□□□□ -1.57
RNQ1YCL028W QCR10P37299 77 aa5.16□□□□□ -1.58
RNQ1YCL028W YOR072W-BQ3E832 53 aa5.13□□□□□ -1.59
RNQ1YCL028W RPS29BP41058 56 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNQ1YCL028W YGL014C-AP0C5N1 53 aa4.98□□□□□ -1.61
RNQ1YCL028W YBR121C-AP0C5L4 52 aa4.94□□□□□ -1.62
RNQ1YCL028W RPS29AP41057 56 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNQ1YCL028W YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa4.88□□□□□ -1.63
RNQ1YCL028W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNQ1YCL028W HHY1P39982 102 aa4.85□□□□□ -1.63
RNQ1YCL028W SOM1Q05676 74 aa4.85□□□□□ -1.63
RNQ1YCL028W RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RNQ1YCL028W YML100W-AQ8TGT0 57 aa4.71□□□□□ -1.66
RNQ1YCL028W YBR072C-AQ3E794 53 aa4.68□□□□□ -1.66
RNQ1YCL028W YOR376W-AQ3E805 51 aa4.66□□□□□ -1.66
RNQ1YCL028W YER078W-AQ3E7A2 54 aa4.26□□□□□ -1.73
RNQ1YCL028W YHR050W-AQ05451 56 aa4.22□□□□□ -1.73
RNQ1YCL028W YAL067W-AQ8TGK6 75 aa3.82□□□□□ -1.8
RNQ1YCL028W YOL164W-AQ3E7A5 60 aa3.55□□□□□ -1.84
RNQ1YCL028W YHR032W-AP0C5N6 59 aa3.41□□□□□ -1.86
RNQ1YCL028W YLR157W-EP0CF00 54 aa3.4□□□□□ -1.87
RNQ1YCL028W YHR086W-AQ3E746 53 aa2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.3 ms