RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633494.1

SEMA4A-216, Transcript of semaphorin 4A, human

TSL 4

Gene SEMA4A, Length 531 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA4A-216	ENST00000633494	SIRT1	Q96EB6	747 aa		29.49	■■■□□ 2.31
SEMA4A-216	ENST00000633494	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		29.48	■■■□□ 2.31
SEMA4A-216	ENST00000633494	SOCS7	O14512	581 aa		29.48	■■■□□ 2.31
SEMA4A-216	ENST00000633494	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		29.48	■■■□□ 2.31
SEMA4A-216	ENST00000633494	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		29.45	■■■□□ 2.31
SEMA4A-216	ENST00000633494	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	29.43	■■■□□ 2.3
SEMA4A-216	ENST00000633494	ORAI2	Q96SN7	254 aa		29.43	■■■□□ 2.3
SEMA4A-216	ENST00000633494	DLC1	Q96QB1	1528 aa		29.41	■■■□□ 2.3
SEMA4A-216	ENST00000633494	ADGRB1	O14514	1584 aa		29.4	■■■□□ 2.3
SEMA4A-216	ENST00000633494	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	29.4	■■■□□ 2.3
SEMA4A-216	ENST00000633494	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	29.39	■■■□□ 2.3
SEMA4A-216	ENST00000633494	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		29.38	■■■□□ 2.29
SEMA4A-216	ENST00000633494	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		29.37	■■■□□ 2.29
SEMA4A-216	ENST00000633494	LRP6	O75581	1613 aa		29.37	■■■□□ 2.29
SEMA4A-216	ENST00000633494	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
SEMA4A-216	ENST00000633494	PRAM1	Q96QH2	718 aa		29.36	■■■□□ 2.29
SEMA4A-216	ENST00000633494	POGK	Q9P215	609 aa		29.36	■■■□□ 2.29
SEMA4A-216	ENST00000633494	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	29.34	■■■□□ 2.29
SEMA4A-216	ENST00000633494	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		29.33	■■■□□ 2.29
SEMA4A-216	ENST00000633494	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		29.33	■■■□□ 2.29
SEMA4A-216	ENST00000633494	NUTM2F	A1L443	756 aa		29.32	■■■□□ 2.28
SEMA4A-216	ENST00000633494	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		29.32	■■■□□ 2.28
SEMA4A-216	ENST00000633494	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
SEMA4A-216	ENST00000633494	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
SEMA4A-216	ENST00000633494	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	29.31	■■■□□ 2.28
SEMA4A-216	ENST00000633494	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
SEMA4A-216	ENST00000633494	KIF1A	Q12756	1690 aa		29.29	■■■□□ 2.28
SEMA4A-216	ENST00000633494	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SEMA4A-216	ENST00000633494	ADGRB2	O60241	1585 aa		29.27	■■■□□ 2.28
SEMA4A-216	ENST00000633494	POTEA	Q6S8J7	498 aa		29.27	■■■□□ 2.28
SEMA4A-216	ENST00000633494	PXDN	Q92626	1479 aa		29.24	■■■□□ 2.27
SEMA4A-216	ENST00000633494	FOXO3	O43524	673 aa		29.24	■■■□□ 2.27
SEMA4A-216	ENST00000633494	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
SEMA4A-216	ENST00000633494	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
SEMA4A-216	ENST00000633494	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
SEMA4A-216	ENST00000633494	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
SEMA4A-216	ENST00000633494	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		29.2	■■■□□ 2.27
SEMA4A-216	ENST00000633494	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
SEMA4A-216	ENST00000633494	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
SEMA4A-216	ENST00000633494	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
SEMA4A-216	ENST00000633494	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SEMA4A-216	ENST00000633494	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
SEMA4A-216	ENST00000633494	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SEMA4A-216	ENST00000633494	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
SEMA4A-216	ENST00000633494	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SEMA4A-216	ENST00000633494	USP32	Q8NFA0	1604 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SEMA4A-216	ENST00000633494	NEUROD1	Q13562	356 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SEMA4A-216	ENST00000633494	AFF2	P51816	1311 aa		29.14	■■■□□ 2.25
SEMA4A-216	ENST00000633494	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
SEMA4A-216	ENST00000633494	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SEMA4A-216	ENST00000633494	C8orf37	Q96NL8	207 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SEMA4A-216	ENST00000633494	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SEMA4A-216	ENST00000633494	ADAMTS2	O95450	1211 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SEMA4A-216	ENST00000633494	PSME1	Q06323	249 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SEMA4A-216	ENST00000633494	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SEMA4A-216	ENST00000633494	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SEMA4A-216	ENST00000633494	NGLY1	Q96IV0	654 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SEMA4A-216	ENST00000633494	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SEMA4A-216	ENST00000633494	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SEMA4A-216	ENST00000633494	SBNO1	A3KN83	1393 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SEMA4A-216	ENST00000633494	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SEMA4A-216	ENST00000633494	ITSN1	Q15811	1721 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SEMA4A-216	ENST00000633494	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
SEMA4A-216	ENST00000633494	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SEMA4A-216	ENST00000633494	RXRB	P28702	533 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SEMA4A-216	ENST00000633494	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		29.01	■■■□□ 2.24
SEMA4A-216	ENST00000633494	ARHGEF10	O15013	1369 aa		29	■■■□□ 2.23
SEMA4A-216	ENST00000633494	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
SEMA4A-216	ENST00000633494	ATP7B	P35670	1465 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SEMA4A-216	ENST00000633494	CDK19	Q9BWU1	502 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SEMA4A-216	ENST00000633494	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
SEMA4A-216	ENST00000633494	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
SEMA4A-216	ENST00000633494	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SEMA4A-216	ENST00000633494	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
SEMA4A-216	ENST00000633494	USP21	Q9UK80	565 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SEMA4A-216	ENST00000633494	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
SEMA4A-216	ENST00000633494	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
SEMA4A-216	ENST00000633494	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
SEMA4A-216	ENST00000633494	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SEMA4A-216	ENST00000633494	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
SEMA4A-216	ENST00000633494	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
SEMA4A-216	ENST00000633494	TONSL	Q96HA7	1378 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SEMA4A-216	ENST00000633494	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
SEMA4A-216	ENST00000633494	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SEMA4A-216	ENST00000633494	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
SEMA4A-216	ENST00000633494	ALS2	Q96Q42	1657 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SEMA4A-216	ENST00000633494	ABCA3	Q99758	1704 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SEMA4A-216	ENST00000633494	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SEMA4A-216	ENST00000633494	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
SEMA4A-216	ENST00000633494	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SEMA4A-216	ENST00000633494	ATRN	O75882	1429 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SEMA4A-216	ENST00000633494	PLEKHG5	O94827	1062 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SEMA4A-216	ENST00000633494	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SEMA4A-216	ENST00000633494	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SEMA4A-216	ENST00000633494	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SEMA4A-216	ENST00000633494	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
SEMA4A-216	ENST00000633494	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
SEMA4A-216	ENST00000633494	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SEMA4A-216	ENST00000633494	RGS12	O14924	1447 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SEMA4A-216	ENST00000633494	SLIT2	O94813	1529 aa		28.84	■■■□□ 2.21

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