RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557092.5

NEDD1-209, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-209ENST00000557092 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.89■■□□□ 1.9
NEDD1-209ENST00000557092 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.89■■□□□ 1.9
NEDD1-209ENST00000557092 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
NEDD1-209ENST00000557092 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.88■■□□□ 1.89
NEDD1-209ENST00000557092 ORAI2Q96SN7 254 aa26.86■■□□□ 1.89
NEDD1-209ENST00000557092 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
NEDD1-209ENST00000557092 LRP6O75581 1613 aa26.83■■□□□ 1.89
NEDD1-209ENST00000557092 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
NEDD1-209ENST00000557092 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
NEDD1-209ENST00000557092 SIRT1Q96EB6 747 aa26.82■■□□□ 1.88
NEDD1-209ENST00000557092 NUTM2FA1L443 756 aa26.81■■□□□ 1.88
NEDD1-209ENST00000557092 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.81■■□□□ 1.88
NEDD1-209ENST00000557092 STAC3Q96MF2 364 aa26.81■■□□□ 1.88
NEDD1-209ENST00000557092 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
NEDD1-209ENST00000557092 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
NEDD1-209ENST00000557092 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
NEDD1-209ENST00000557092 ADGRB1O14514 1584 aa26.8■■□□□ 1.88
NEDD1-209ENST00000557092 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
NEDD1-209ENST00000557092 PRAM1Q96QH2 718 aa26.78■■□□□ 1.88
NEDD1-209ENST00000557092 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.77■■□□□ 1.88
NEDD1-209ENST00000557092 DLC1Q96QB1 1528 aa26.77■■□□□ 1.88
NEDD1-209ENST00000557092 POGKQ9P215 609 aa26.77■■□□□ 1.88
NEDD1-209ENST00000557092 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.76■■□□□ 1.87
NEDD1-209ENST00000557092 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
NEDD1-209ENST00000557092 POTEAQ6S8J7 498 aa26.75■■□□□ 1.87
NEDD1-209ENST00000557092 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.74■■□□□ 1.87
NEDD1-209ENST00000557092 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.73■■□□□ 1.87
NEDD1-209ENST00000557092 FOXO3O43524 673 aa26.7■■□□□ 1.86
NEDD1-209ENST00000557092 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
NEDD1-209ENST00000557092 KIF1AQ12756 1690 aa26.68■■□□□ 1.86
NEDD1-209ENST00000557092 PXDNQ92626 1479 aa26.67■■□□□ 1.86
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
NEDD1-209ENST00000557092 ADGRB2O60241 1585 aa26.66■■□□□ 1.86
NEDD1-209ENST00000557092 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
NEDD1-209ENST00000557092 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
NEDD1-209ENST00000557092 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
NEDD1-209ENST00000557092 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
NEDD1-209ENST00000557092 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.62■■□□□ 1.85
NEDD1-209ENST00000557092 C8orf37Q96NL8 207 aa26.62■■□□□ 1.85
NEDD1-209ENST00000557092 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.62■■□□□ 1.85
NEDD1-209ENST00000557092 ADAMTS2O95450 1211 aa26.61■■□□□ 1.85
NEDD1-209ENST00000557092 AFF2P51816 1311 aa26.61■■□□□ 1.85
NEDD1-209ENST00000557092 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.6■■□□□ 1.85
NEDD1-209ENST00000557092 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
NEDD1-209ENST00000557092 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.59■■□□□ 1.85
NEDD1-209ENST00000557092 NEUROD1Q13562 356 aa26.58■■□□□ 1.85
NEDD1-209ENST00000557092 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
NEDD1-209ENST00000557092 USP32Q8NFA0 1604 aa26.57■■□□□ 1.84
NEDD1-209ENST00000557092 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.56■■□□□ 1.84
NEDD1-209ENST00000557092 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.56■■□□□ 1.84
NEDD1-209ENST00000557092 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
NEDD1-209ENST00000557092 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
NEDD1-209ENST00000557092 NGLY1Q96IV0 654 aa26.55■■□□□ 1.84
NEDD1-209ENST00000557092 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.55■■□□□ 1.84
NEDD1-209ENST00000557092 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.54■■□□□ 1.84
NEDD1-209ENST00000557092 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.54■■□□□ 1.84
NEDD1-209ENST00000557092 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.53■■□□□ 1.84
NEDD1-209ENST00000557092 PSME1Q06323 249 aa26.52■■□□□ 1.84
NEDD1-209ENST00000557092 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.5■■□□□ 1.83
NEDD1-209ENST00000557092 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.5■■□□□ 1.83
NEDD1-209ENST00000557092 RXRBP28702 533 aa26.5■■□□□ 1.83
NEDD1-209ENST00000557092 SBNO1A3KN83 1393 aa26.46■■□□□ 1.83
NEDD1-209ENST00000557092 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.46■■□□□ 1.83
NEDD1-209ENST00000557092 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
NEDD1-209ENST00000557092 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
NEDD1-209ENST00000557092 USP21Q9UK80 565 aa26.45■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 ITSN1Q15811 1721 aa26.45■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 PLEKHG5O94827 1062 aa26.44■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.44■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.43■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 ATP7BP35670 1465 aa26.43■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 CDK19Q9BWU1 502 aa26.43■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 ARHGEF10O15013 1369 aa26.42■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
NEDD1-209ENST00000557092 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.38■■□□□ 1.81
NEDD1-209ENST00000557092 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.38■■□□□ 1.81
NEDD1-209ENST00000557092 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
NEDD1-209ENST00000557092 ABCA3Q99758 1704 aa26.36■■□□□ 1.81
NEDD1-209ENST00000557092 TONSLQ96HA7 1378 aa26.35■■□□□ 1.81
NEDD1-209ENST00000557092 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.35■■□□□ 1.81
NEDD1-209ENST00000557092 RGS12O14924 1447 aa26.34■■□□□ 1.81
NEDD1-209ENST00000557092 ATRNO75882 1429 aa26.34■■□□□ 1.81
NEDD1-209ENST00000557092 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
NEDD1-209ENST00000557092 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
NEDD1-209ENST00000557092 ALS2Q96Q42 1657 aa26.34■■□□□ 1.81
NEDD1-209ENST00000557092 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.33■■□□□ 1.81
NEDD1-209ENST00000557092 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.33■■□□□ 1.81
NEDD1-209ENST00000557092 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.31■■□□□ 1.8
NEDD1-209ENST00000557092 SLIT2O94813 1529 aa26.29■■□□□ 1.8
NEDD1-209ENST00000557092 CABP2Q9NPB3 220 aa26.29■■□□□ 1.8
NEDD1-209ENST00000557092 ACEP12821 1306 aa26.29■■□□□ 1.8
NEDD1-209ENST00000557092 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
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