RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.17■■■■□ 3.38
LAPTM4B-202ENST00000517924 LRP6O75581 1613 aa36.16■■■■□ 3.38
LAPTM4B-202ENST00000517924 ORAI2Q96SN7 254 aa36.15■■■■□ 3.38
LAPTM4B-202ENST00000517924 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.15■■■■□ 3.38
LAPTM4B-202ENST00000517924 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.13■■■■□ 3.37
LAPTM4B-202ENST00000517924 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
LAPTM4B-202ENST00000517924 ADGRB1O14514 1584 aa36.08■■■■□ 3.37
LAPTM4B-202ENST00000517924 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa36.08■■■■□ 3.37
LAPTM4B-202ENST00000517924 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.05■■■■□ 3.36
LAPTM4B-202ENST00000517924 NUTM2FA1L443 756 aa36.04■■■■□ 3.36
LAPTM4B-202ENST00000517924 POTEAQ6S8J7 498 aa36.03■■■■□ 3.36
LAPTM4B-202ENST00000517924 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
LAPTM4B-202ENST00000517924 SIRT1Q96EB6 747 aa36.01■■■■□ 3.36
LAPTM4B-202ENST00000517924 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
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LAPTM4B-202ENST00000517924 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
LAPTM4B-202ENST00000517924 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36■■■■□ 3.35
LAPTM4B-202ENST00000517924 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
LAPTM4B-202ENST00000517924 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.99■■■■□ 3.35
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRAM1Q96QH2 718 aa35.99■■■■□ 3.35
LAPTM4B-202ENST00000517924 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.99■■■■□ 3.35
LAPTM4B-202ENST00000517924 DLC1Q96QB1 1528 aa35.98■■■■□ 3.35
LAPTM4B-202ENST00000517924 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
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LAPTM4B-202ENST00000517924 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.94■■■■□ 3.34
LAPTM4B-202ENST00000517924 STAC3Q96MF2 364 aa35.92■■■■□ 3.34
LAPTM4B-202ENST00000517924 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
LAPTM4B-202ENST00000517924 PXDNQ92626 1479 aa35.9■■■■□ 3.34
LAPTM4B-202ENST00000517924 FOXO3O43524 673 aa35.89■■■■□ 3.34
LAPTM4B-202ENST00000517924 POGKQ9P215 609 aa35.89■■■■□ 3.34
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
LAPTM4B-202ENST00000517924 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.86■■■■□ 3.33
LAPTM4B-202ENST00000517924 ADGRB2O60241 1585 aa35.85■■■■□ 3.33
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIF1AQ12756 1690 aa35.85■■■■□ 3.33
LAPTM4B-202ENST00000517924 USP32Q8NFA0 1604 aa35.84■■■■□ 3.33
LAPTM4B-202ENST00000517924 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.82■■■■□ 3.32
LAPTM4B-202ENST00000517924 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
LAPTM4B-202ENST00000517924 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.81■■■■□ 3.32
LAPTM4B-202ENST00000517924 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
LAPTM4B-202ENST00000517924 AFF2P51816 1311 aa35.77■■■■□ 3.32
LAPTM4B-202ENST00000517924 ADAMTS2O95450 1211 aa35.75■■■■□ 3.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.75■■■■□ 3.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 C8orf37Q96NL8 207 aa35.75■■■■□ 3.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.74■■■■□ 3.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.72■■■■□ 3.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 NEUROD1Q13562 356 aa35.7■■■■□ 3.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.7■■■■□ 3.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.69■■■■□ 3.3
LAPTM4B-202ENST00000517924 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.69■■■■□ 3.3
LAPTM4B-202ENST00000517924 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.67■■■■□ 3.3
LAPTM4B-202ENST00000517924 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
LAPTM4B-202ENST00000517924 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.67■■■■□ 3.3
LAPTM4B-202ENST00000517924 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.66■■■■□ 3.3
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LAPTM4B-202ENST00000517924 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
LAPTM4B-202ENST00000517924 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.59■■■■□ 3.29
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.59■■■■□ 3.29
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
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LAPTM4B-202ENST00000517924 PSME1Q06323 249 aa35.57■■■■□ 3.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 ATP7BP35670 1465 aa35.56■■■■□ 3.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 ITSN1Q15811 1721 aa35.55■■■■□ 3.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 SBNO1A3KN83 1393 aa35.54■■■■□ 3.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCA3Q99758 1704 aa35.54■■■■□ 3.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLEKHG5O94827 1062 aa35.53■■■■□ 3.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 CDK19Q9BWU1 502 aa35.52■■■■□ 3.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.52■■■■□ 3.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.51■■■■□ 3.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 USP21Q9UK80 565 aa35.51■■■■□ 3.28
LAPTM4B-202ENST00000517924 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.5■■■■□ 3.27
LAPTM4B-202ENST00000517924 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.5■■■■□ 3.27
LAPTM4B-202ENST00000517924 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
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LAPTM4B-202ENST00000517924 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
LAPTM4B-202ENST00000517924 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
LAPTM4B-202ENST00000517924 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.46■■■■□ 3.27
LAPTM4B-202ENST00000517924 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.45■■■■□ 3.27
LAPTM4B-202ENST00000517924 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.45■■■■□ 3.27
LAPTM4B-202ENST00000517924 RGS12O14924 1447 aa35.44■■■■□ 3.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARHGEF10O15013 1369 aa35.44■■■■□ 3.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 ATRNO75882 1429 aa35.42■■■■□ 3.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
LAPTM4B-202ENST00000517924 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.37■■■■□ 3.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLIT2O94813 1529 aa35.37■■■■□ 3.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35.37■■■■□ 3.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 CABP2Q9NPB3 220 aa35.35■■■■□ 3.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.35■■■■□ 3.25
LAPTM4B-202ENST00000517924 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
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