RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ORAI2Q96SN7 254 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 SIRT1Q96EB6 747 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 STAC3Q96MF2 364 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 LRP6O75581 1613 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ADGRB1O14514 1584 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 NUTM2FA1L443 756 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 PRAM1Q96QH2 718 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 DLC1Q96QB1 1528 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 POTEAQ6S8J7 498 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 POGKQ9P215 609 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 FOXO3O43524 673 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF1AQ12756 1690 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 PXDNQ92626 1479 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 ADGRB2O60241 1585 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 C8orf37Q96NL8 207 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 USP32Q8NFA0 1604 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 AFF2P51816 1311 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 ADAMTS2O95450 1211 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 NEUROD1Q13562 356 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 NGLY1Q96IV0 654 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 PSME1Q06323 249 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 RXRBP28702 533 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 SBNO1A3KN83 1393 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 ITSN1Q15811 1721 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 CDK19Q9BWU1 502 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 USP21Q9UK80 565 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP7BP35670 1465 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGEF10O15013 1369 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHG5O94827 1062 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCA3Q99758 1704 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 ALS2Q96Q42 1657 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 TONSLQ96HA7 1378 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 ATRNO75882 1429 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 RGS12O14924 1447 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 SLIT2O94813 1529 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 ACEP12821 1306 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms