RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, human

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME4-208	ENST00000481518	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
PSME4-208	ENST00000481518	LRP6	O75581	1613 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PSME4-208	ENST00000481518	ORAI2	Q96SN7	254 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PSME4-208	ENST00000481518	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
PSME4-208	ENST00000481518	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PSME4-208	ENST00000481518	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PSME4-208	ENST00000481518	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PSME4-208	ENST00000481518	ADGRB1	O14514	1584 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PSME4-208	ENST00000481518	SIRT1	Q96EB6	747 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PSME4-208	ENST00000481518	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PSME4-208	ENST00000481518	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	33.63	■■■□□ 2.97
PSME4-208	ENST00000481518	POTEA	Q6S8J7	498 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PSME4-208	ENST00000481518	DLC1	Q96QB1	1528 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PSME4-208	ENST00000481518	NUTM2F	A1L443	756 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PSME4-208	ENST00000481518	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PSME4-208	ENST00000481518	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
PSME4-208	ENST00000481518	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PSME4-208	ENST00000481518	PRAM1	Q96QH2	718 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PSME4-208	ENST00000481518	STAC3	Q96MF2	364 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PSME4-208	ENST00000481518	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
PSME4-208	ENST00000481518	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
PSME4-208	ENST00000481518	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
PSME4-208	ENST00000481518	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	33.56	■■■□□ 2.96
PSME4-208	ENST00000481518	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
PSME4-208	ENST00000481518	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PSME4-208	ENST00000481518	PXDN	Q92626	1479 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PSME4-208	ENST00000481518	POGK	Q9P215	609 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PSME4-208	ENST00000481518	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PSME4-208	ENST00000481518	FOXO3	O43524	673 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PSME4-208	ENST00000481518	ADGRB2	O60241	1585 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PSME4-208	ENST00000481518	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
PSME4-208	ENST00000481518	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
PSME4-208	ENST00000481518	KIF1A	Q12756	1690 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PSME4-208	ENST00000481518	USP32	Q8NFA0	1604 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PSME4-208	ENST00000481518	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
PSME4-208	ENST00000481518	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
PSME4-208	ENST00000481518	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PSME4-208	ENST00000481518	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
PSME4-208	ENST00000481518	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
PSME4-208	ENST00000481518	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PSME4-208	ENST00000481518	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PSME4-208	ENST00000481518	AFF2	P51816	1311 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PSME4-208	ENST00000481518	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PSME4-208	ENST00000481518	ADAMTS2	O95450	1211 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PSME4-208	ENST00000481518	C8orf37	Q96NL8	207 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PSME4-208	ENST00000481518	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PSME4-208	ENST00000481518	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PSME4-208	ENST00000481518	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		33.32	■■■□□ 2.93
PSME4-208	ENST00000481518	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PSME4-208	ENST00000481518	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PSME4-208	ENST00000481518	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PSME4-208	ENST00000481518	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PSME4-208	ENST00000481518	NEUROD1	Q13562	356 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PSME4-208	ENST00000481518	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PSME4-208	ENST00000481518	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.92
PSME4-208	ENST00000481518	NGLY1	Q96IV0	654 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PSME4-208	ENST00000481518	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
PSME4-208	ENST00000481518	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PSME4-208	ENST00000481518	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
PSME4-208	ENST00000481518	ATP7B	P35670	1465 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PSME4-208	ENST00000481518	RXRB	P28702	533 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PSME4-208	ENST00000481518	SBNO1	A3KN83	1393 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PSME4-208	ENST00000481518	PSME1	Q06323	249 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PSME4-208	ENST00000481518	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		33.2	■■■□□ 2.9
PSME4-208	ENST00000481518	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
PSME4-208	ENST00000481518	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
PSME4-208	ENST00000481518	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
PSME4-208	ENST00000481518	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PSME4-208	ENST00000481518	ITSN1	Q15811	1721 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PSME4-208	ENST00000481518	CDK19	Q9BWU1	502 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PSME4-208	ENST00000481518	USP21	Q9UK80	565 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PSME4-208	ENST00000481518	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PSME4-208	ENST00000481518	ABCA3	Q99758	1704 aa		33.14	■■■□□ 2.89
PSME4-208	ENST00000481518	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PSME4-208	ENST00000481518	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PSME4-208	ENST00000481518	ARHGEF10	O15013	1369 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PSME4-208	ENST00000481518	ALS2	Q96Q42	1657 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PSME4-208	ENST00000481518	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
PSME4-208	ENST00000481518	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PSME4-208	ENST00000481518	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PSME4-208	ENST00000481518	PLEKHG5	O94827	1062 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PSME4-208	ENST00000481518	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
PSME4-208	ENST00000481518	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PSME4-208	ENST00000481518	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PSME4-208	ENST00000481518	RGS12	O14924	1447 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PSME4-208	ENST00000481518	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
PSME4-208	ENST00000481518	ATRN	O75882	1429 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PSME4-208	ENST00000481518	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PSME4-208	ENST00000481518	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
PSME4-208	ENST00000481518	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
PSME4-208	ENST00000481518	SLIT2	O94813	1529 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PSME4-208	ENST00000481518	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
PSME4-208	ENST00000481518	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PSME4-208	ENST00000481518	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
PSME4-208	ENST00000481518	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.88
PSME4-208	ENST00000481518	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PSME4-208	ENST00000481518	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PSME4-208	ENST00000481518	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
PSME4-208	ENST00000481518	CABP2	Q9NPB3	220 aa		32.98	■■■□□ 2.87

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