RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216129.6

TTLL12-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL12, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL12-201ENST00000216129 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.44■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 C14orf37Q86TY3 774 aa23.44■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.43■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.43■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.42■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.42■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 PTPRTO14522 1441 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 RIPK4P57078 832 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.39■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 TRPM2O94759 1503 aa23.39■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 ERVK-7P63135 1459 aa23.39■■□□□ 1.34
TTLL12-201ENST00000216129 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TTLL12-201ENST00000216129 ARXQ96QS3 562 aa23.39■■□□□ 1.33
TTLL12-201ENST00000216129 IGHDP01880 384 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL12-201ENST00000216129 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TTLL12-201ENST00000216129 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL12-201ENST00000216129 BACH2Q9BYV9 841 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL12-201ENST00000216129 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL12-201ENST00000216129 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.35■■□□□ 1.33
TTLL12-201ENST00000216129 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TTLL12-201ENST00000216129 RLBP1P12271 317 aa23.34■■□□□ 1.33
TTLL12-201ENST00000216129 NME9Q86XW9 330 aa23.34■■□□□ 1.33
TTLL12-201ENST00000216129 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.34■■□□□ 1.33
TTLL12-201ENST00000216129 FYB1O15117 783 aa23.33■■□□□ 1.33
TTLL12-201ENST00000216129 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
TTLL12-201ENST00000216129 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
TTLL12-201ENST00000216129 PRKAR2BP31323 418 aa23.32■■□□□ 1.32
TTLL12-201ENST00000216129 MADDQ8WXG6 1647 aa23.32■■□□□ 1.32
TTLL12-201ENST00000216129 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.31■■□□□ 1.32
TTLL12-201ENST00000216129 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
TTLL12-201ENST00000216129 APBB1O00213 710 aa23.3■■□□□ 1.32
TTLL12-201ENST00000216129 DCTN1Q14203 1278 aa23.3■■□□□ 1.32
TTLL12-201ENST00000216129 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.29■■□□□ 1.32
TTLL12-201ENST00000216129 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.28■■□□□ 1.32
TTLL12-201ENST00000216129 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.28■■□□□ 1.32
TTLL12-201ENST00000216129 A0A1W2PP64 1363 aa23.28■■□□□ 1.32
TTLL12-201ENST00000216129 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TTLL12-201ENST00000216129 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TTLL12-201ENST00000216129 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.26■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 CEP152O94986 1710 aa23.26■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.23■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 TET3O43151 1660 aa23.23■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 ZNF521Q96K83 1311 aa23.23■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 TSPOAP1O95153 1857 aa23.23■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.22■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 FAM83GA6ND36 823 aa23.22■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.22■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.22■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 FAM161AQ3B820 660 aa23.21■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.21■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.21■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 PIK3C2GO75747 1445 aa23.21■■□□□ 1.31
TTLL12-201ENST00000216129 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 ABCA6Q8N139 1617 aa23.2■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.2■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.19■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.19■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 NECTIN2Q92692 538 aa23.18■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 COG3Q96JB2 828 aa23.18■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 MS4A1P11836 297 aa23.16■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.16■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.16■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 SEC24BO95487 1268 aa23.15■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.15■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.15■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 KIF1BO60333 1816 aa23.15■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
TTLL12-201ENST00000216129 LNPKQ9C0E8 428 aa23.13■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 ABCC3O15438 1527 aa23.13■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.12■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 POLKQ9UBT6 870 aa23.12■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.11■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 IL27Q8NEV9 243 aa23.11■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 ZNF428Q96B54 188 aa23.11■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 KRT24Q2M2I5 525 aa23.11■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 MROH2AA6NES4 1674 aa23.11■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 TRIM27P14373 513 aa23.1■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.1■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.1■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
TTLL12-201ENST00000216129 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms