RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J NHP2P32495 156 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J MSA2P36157 363 aa1.48□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J UIP3P39547 235 aa1.48□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J HUR1P45820 110 aa1.48□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J OST2P46964 130 aa1.48□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL37BP51402 88 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J CWC27Q02770 301 aa1.48□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J FYV7Q12247 151 aa1.48□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP1.47□□□□□ -2.17
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR157W-DP0CE99 70 aa1.46□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J YER181CP40097 107 aa1.46□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J SFT1P43682 97 aa1.46□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J YAR1P46683 200 aa1.46□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J YCR043CP25361 127 aa1.45□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL045CP32616 141 aa1.45□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J DSE2P38844 325 aa1.45□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J PAI3P01094 68 aa1.44□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR107C-AP0CT86 78 aa1.44□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J LSM6Q06406 86 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J TSC3Q3E790 80 aa1.44□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J SAE3P89114 91 aa1.43□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR296WQ05898 108 aa1.43□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR363W-AQ3E747 85 aa1.43□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa1.43□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J TDA8Q6B2U8 126 aa1.43□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR213W-BQ8TGK1 99 aa1.43□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J MIC10Q96VH5 97 aa1.43□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J YFR009W-AP0C5M9 85 aa1.42□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J ICS3P47034 131 aa1.42□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J CGR1P53188 120 aa1.42□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J RSM19P53733 91 aaPredicted RBP1.42□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR162WQ06235 118 aa1.42□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR361C-AQ3E795 98 aa1.42□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL133C-AQ3E7A3 74 aa1.42□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J POP7P38291 140 aa1.41□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J COF1Q03048 143 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL069WP36088 180 aa1.4□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL38P49167 78 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J ATP18P81450 59 aa1.4□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM19Q06011 112 aa1.4□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J YER187WP40102 141 aa1.39□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J GLC8P41818 229 aa1.39□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J EDC1P53080 175 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J SHH4Q06236 168 aa1.39□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J FYV12Q08559 129 aa1.39□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J LSM8P47093 109 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL014WQ08110 124 aa1.38□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR381C-AQ3E6R5 114 aa1.38□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL144WP47009 104 aa1.37□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL102C-AQ2V2P5 75 aa1.37□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J YHL042WP38729 150 aa1.36□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J COX23P38824 151 aa1.36□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J TDA2P40045 126 aa1.36□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL198CP40166 100 aa1.36□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J Q0017Q9ZZX8 53 aa1.36□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR304C-AO14468 76 aa1.35□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J RPP2AP05319 106 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL009WP47078 108 aa1.35□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR128WP47162 119 aa1.35□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR182C-AQ8TGU6 64 aa1.35□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD6P06104 172 aa1.34□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J YAR064WP39563 99 aa1.34□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL012CQ12489 107 aa1.34□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J ISD11Q6Q560 94 aa1.34□□□□□ -2.19
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR073W-AP0C5N7 58 aa1.33□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J SKI6P46948 246 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR210WQ03482 75 aa1.33□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR153WQ06537 140 aa1.33□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J ATP20Q12233 115 aa1.33□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR316C-AQ3E806 69 aa1.33□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J HHF1P02309 103 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR170W-BP0C5R9 85 aa1.32□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR164WP53291 111 aa1.32□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL080CQ02826 108 aa1.32□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J YCR050CP25630 102 aa1.31□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J RPA12P32529 125 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J SOH1P38633 127 aa1.31□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL034CP53186 121 aa1.3□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR039WP53225 103 aa1.28□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR285C-AQ3E771 56 aa1.28□□□□□ -2.2
tW(CCA)JtW(CCA)J YCR085WP25650 117 aa1.27□□□□□ -2.21
tW(CCA)JtW(CCA)J EMC6Q12431 108 aa1.27□□□□□ -2.21
tW(CCA)JtW(CCA)J INO4P13902 151 aa1.26□□□□□ -2.21
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
tW(CCA)JtW(CCA)J ATX1P38636 73 aa1.25□□□□□ -2.21
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL102CP40488 101 aa1.25□□□□□ -2.21
tW(CCA)JtW(CCA)J LIP1Q03579 150 aa1.25□□□□□ -2.21
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL156W-BQ2V2P4 73 aa1.25□□□□□ -2.21
tW(CCA)JtW(CCA)J YBL008W-AQ3E821 79 aa1.25□□□□□ -2.21
tW(CCA)JtW(CCA)J COX8P04039 78 aa1.24□□□□□ -2.21
tW(CCA)JtW(CCA)J YBL044WP38194 122 aa1.24□□□□□ -2.21
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR016WP38216 128 aa1.24□□□□□ -2.21
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS29AP41057 56 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS29BP41058 56 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
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