RNA–Protein interactions for RNA: YPL178W

CBC2, Transcript of Small subunit of the heterodimeric cap binding complex with Sto1p, yeastyeast

Gene CBC2, Length 627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CBC2YPL178W AQY2P0CD90 149 aa3.62□□□□□ -1.83
CBC2YPL178W BET1P22804 142 aa3.62□□□□□ -1.83
CBC2YPL178W LCL1Q02786 101 aa3.62□□□□□ -1.83
CBC2YPL178W EMC6Q12431 108 aa3.61□□□□□ -1.83
CBC2YPL178W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa3.61□□□□□ -1.83
CBC2YPL178W MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CBC2YPL178W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CBC2YPL178W YLR307C-AQ3E825 87 aa3.6□□□□□ -1.83
CBC2YPL178W YBL039W-BP0C268 59 aa3.59□□□□□ -1.83
CBC2YPL178W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CBC2YPL178W MVB12P42939 101 aa3.59□□□□□ -1.83
CBC2YPL178W YFL019CP43576 117 aa3.59□□□□□ -1.83
CBC2YPL178W Q0032Q9ZZX7 96 aa3.59□□□□□ -1.83
CBC2YPL178W YDL022C-AP0C5L6 82 aa3.58□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W MIC10Q96VH5 97 aa3.58□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W MRPS12P53732 153 aa3.57□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W YLL006W-AQ3E814 58 aa3.57□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W YER187WP40102 141 aa3.56□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W AIM19P40502 157 aa3.56□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W YSY6P38374 65 aa3.55□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W TSC3Q3E790 80 aa3.55□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W DSE2P38844 325 aa3.54□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W YNL190WP53872 204 aa3.54□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W YEL067CP39978 195 aa3.53□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W YIA6P40556 373 aa3.53□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W YNR077CP53758 84 aa3.53□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W YOR020W-AQ3E824 90 aa3.53□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W TDA8Q6B2U8 126 aa3.53□□□□□ -1.84
CBC2YPL178W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W RSM18P40033 138 aa3.52□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W YFL067WP43537 175 aa3.52□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W YGL193CP53097 103 aa3.52□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W ICY1Q04329 127 aa3.51□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W IGD1P43598 195 aa3.5□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W ICS3P47034 131 aa3.5□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W SPG1P50088 95 aa3.5□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W YOR376W-AQ3E805 51 aa3.5□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W HUR1P45820 110 aa3.49□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W YGL034CP53186 121 aa3.49□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W RGM1Q00453 211 aa3.49□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W YML100W-AQ8TGT0 57 aa3.49□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W DDR48P18899 430 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W TDA2P40045 126 aa3.48□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W YOR268CQ08734 132 aa3.48□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W YDR246W-AQ3E763 66 aa3.48□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W HHF1P02309 103 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W AIM4P38305 123 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W YHL005CP38752 130 aa3.47□□□□□ -1.85
CBC2YPL178W YGL149WP53116 101 aa3.46□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W DDR2P89113 61 aa3.46□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W IRC21Q04772 201 aa3.46□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YOR314WQ12506 109 aa3.46□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa3.46□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa3.46□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YEL045CP32616 141 aa3.45□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W FYV5P25585 152 aa3.44□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YLR162WQ06235 118 aa3.44□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YBR230W-AQ3E762 66 aa3.44□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YOR381W-AQ3E804 55 aa3.44□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YJL127C-BQ3E828 52 aa3.44□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YLR236CA0A023PZG4 107 aa3.43□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa3.43□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YLR156WP0CE96 114 aa3.42□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YLR159WP0CE97 114 aa3.42□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YLR161WP0CE98 114 aa3.42□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W MSA2P36157 363 aa3.42□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W ATP20Q12233 115 aa3.42□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YDR010CQ12426 110 aa3.42□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YLR285C-AQ3E771 56 aa3.42□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YGR121W-AQ3E816 71 aa3.42□□□□□ -1.86
CBC2YPL178W YJR085CP47131 105 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W MPC3P53311 146 aa3.4□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W YOR034C-AQ3E735 80 aa3.4□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W BSC4P53841 131 aa3.39□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W YDR182W-AQ3E796 67 aa3.39□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa3.39□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W OST5Q92316 86 aa3.39□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W YER188C-AP0C0V2 99 aa3.38□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W RPL36BO14455 100 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W YCR043CP25361 127 aa3.37□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W YHR007C-AQ07074 71 aa3.37□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W YOR072WQ08486 104 aa3.37□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W YJL197C-AP0C5P0 93 aa3.36□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W YMR122CQ03879 124 aa3.36□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W EDC1P53080 175 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W YOL014WQ08110 124 aa3.34□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W YFR032C-BQ8TGU2 87 aa3.34□□□□□ -1.87
CBC2YPL178W QCR10P37299 77 aa3.33□□□□□ -1.88
CBC2YPL178W YPR153WQ06537 140 aa3.33□□□□□ -1.88
CBC2YPL178W NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CBC2YPL178W YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa3.32□□□□□ -1.88
CBC2YPL178W YJR107C-AP0CT86 78 aa3.31□□□□□ -1.88
CBC2YPL178W YBR027CP38220 110 aa3.3□□□□□ -1.88
CBC2YPL178W RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CBC2YPL178W RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CBC2YPL178W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa3.29□□□□□ -1.88
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