RNA–Protein interactions for RNA: YMR025W

CSI1, Transcript of Subunit of the Cop9 signalosome, yeast

Gene CSI1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI1	YMR025W	YNL190W	P53872	204 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	AIM11	P87275	137 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	DDR2	P89113	61 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	YMR103C	Q04436	120 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	HPA2	Q06592	156 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	ZEO1	Q08245	113 aa		0.94	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	YPL261C	Q08976	102 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		0.93	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	ATP5	P09457	212 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	UGX2	P32772	223 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	HHO1	P53551	258 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	MRPS12	P53732	153 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	PAU17	Q12370	124 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	COX7	P10174	60 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	FYV5	P25585	152 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	GTT1	P40582	234 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	NSE4	P43124	402 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	SFT1	P43682	97 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	ICY1	Q04329	127 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	SCS22	Q6Q595	175 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CSI1	YMR025W	YKL044W	P36092	106 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YBR027C	P38220	110 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YHL005C	P38752	130 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	BSC4	P53841	131 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	ARL3	Q02804	198 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	IRC21	Q04772	201 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	CNL1	Q06333	122 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YOR072W	Q08486	104 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	FYV7	Q12247	151 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YHR130C	P38834	111 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	PAU23	Q07987	124 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	MRPL44	P19956	98 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YGL230C	P53074	147 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YDL157C	Q12082	118 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	COA6	Q3E846	104 aa		0.87	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	RAD6	P06104	172 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	FUN14	P18411	198 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	RSM18	P40033	138 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		0.86	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	SSS1	P35179	80 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	ELC1	Q03071	99 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YER181C	P40097	107 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	HUR1	P45820	110 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	NAT5	Q08689	176 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YPR203W	Q08994	102 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSI1	YMR025W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	POP7	P38291	140 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	MIC10	Q96VH5	97 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YOR304C-A	O14468	76 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	ICS3	P47034	131 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YJR128W	P47162	119 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YDR210W	Q03482	75 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	LIP1	Q03579	150 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	PAI3	P01094	68 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YGR164W	P53291	111 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	SEN15	Q04675	128 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		0.81	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	COX23	P38824	151 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	GLC8	P41818	229 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YJL009W	P47078	108 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	ATP18	P81450	59 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	SAE3	P89114	91 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YLR296W	Q05898	108 aa		0.8	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YLR255C	O13574	117 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YCR050C	P25630	102 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YER187W	P40102	141 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		0.79	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	INO4	P13902	151 aa		0.78	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	TDA2	P40045	126 aa		0.78	□□□□□ -2.28
CSI1	YMR025W	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		0.78	□□□□□ -2.28

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