RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518963.5

PSD3-208, Transcript of pleckstrin and Sec7 domain containing 3, human

TSL 2

Gene PSD3, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSD3-208	ENST00000518963	MPPED1	O15442	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ESRRB	O95718	433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	HKR1	P10072	659 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	NR2F6	P10588	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	YY1	P25490	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	MCM7	P33993	719 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	GATM	P50440	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	KLF10	Q13118	480 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	STARD3	Q14849	445 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	KAZN	Q674X7	775 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SNX27	Q96L92	541 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	FFAR2	O15552	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SH3BP5	O60239	455 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	TLR5	O60602	858 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	NBN	O60934	754 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	FZD7	O75084	574 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	EGR1	P18146	543 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PROZ	P22891	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ITPKB	P27987	946 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	HTR7	P34969	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	TIRAP	P58753	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	FSTL1	Q12841	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	MPP3	Q13368	585 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PBK	Q96KB5	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	LINC00473	A8K010	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	NPC1	O15118	1278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	COQ9	O75208	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	TYRP1	P17643	537 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	CTGF	P29279	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ELF2	Q15723	593 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	USP51	Q70EK9	711 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSD3-208	ENST00000518963	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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