RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423431.5

SPCS1-202, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SPCS1, Length 822 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-202ENST00000423431 PPP2R5CQ13362 524 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 EPHA7Q15375 998 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ARMCX5Q6P1M9 558 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 DSTYKQ6XUX3 929 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 CHSY3Q70JA7 882 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 CD163Q86VB7 1156 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 STKLD1Q8NE28 680 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 VAV3Q9UKW4 847 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 PI4KAP42356 2102 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.5□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 OR6C75A6NL08 312 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 SLC37A4O43826 429 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 BRINP1O60477 761 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 LARGE1O95461 756 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 NFATC1O95644 943 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 APODP05090 189 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 CKMP06732 381 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.892e-6■□□□□ 10.7
SPCS1-202ENST00000423431 RPL9P32969 192 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 NLRP12P59046 1061 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 NLRP5P59047 1200 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 NFKB2Q00653 900 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 AAMPQ13685 434 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 FAM187BQ17R55 369 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 CCDC148Q8NFR7 591 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 DEPTORQ8TB45 409 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 GMIPQ9P107 970 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ARID2Q68CP9 1835 aa9.49□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 BTBD18B2RXH4 712 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ACKR2O00590 384 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF217O75362 1048 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 KAT7O95251 611 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF883P0CG24 379 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 CD33P20138 364 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 CHRNA4P43681 627 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 CCR10P46092 362 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF77Q15935 545 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 INF2Q27J81 1249 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 SLC39A12Q504Y0 691 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ATF7IP2Q5U623 682 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 OVOS1Q6IE37 1185 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 USP49Q70CQ1 688 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 TMEM150AQ86TG1 271 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 MON1AQ86VX9 555 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 PIGOQ8TEQ8 1089 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 TTC9Q92623 222 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 PNKPQ96T60 521 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 NRSN2Q9GZP1 204 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 CD93Q9NPY3 652 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 FTSJ1Q9UET6 329 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 USP3Q9Y6I4 520 aa9.48□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 A0A1B0GVT2 93 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 KCNK3O14649 394 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 OAZ2O95190 189 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 HOXB2P14652 356 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ATP2B1P20020 1258 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 CYP3A7P24462 503 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ADH6P28332 368 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 TNFSF9P41273 254 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 UCNP55089 124 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 IL9RQ01113 521 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 MESP2Q0VG99 397 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 RTP5Q14D33 572 aa9.47□□□□□ -0.89
SPCS1-202ENST00000423431 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms