RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRRX2Q99811 253 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 GDF15Q99988 308 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 VN1R3Q9BXE9 311 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPRHQ9HD43 1115 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMOD4Q9NZQ9 345 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 DKK3Q9UBP4 350 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS51Q9UID3 782 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 RIMKLBQ9ULI2 386 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC151A5D8V7 595 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTLL1O95922 423 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 VIPP01282 170 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERBB2P04626 1255 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 EBLN1P0CF75 366 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARP10275 920 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 YY1P25490 414 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCSK6P29122 969 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 NTSR1P30989 418 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDE1AP54750 535 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZXDAP98168 799 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 FSTL1Q12841 308 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELF2Q15723 593 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAPKAPK3Q16644 382 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 LY6KQ17RY6 165 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANO1Q5XXA6 986 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAP1GAP2Q684P5 730 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERAP2Q6P179 960 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 GGT6Q6P531 493 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA0408Q6ZU52 694 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP49Q70CQ1 688 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 GGNQ86UU5 652 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 GATAD2AQ86YP4 633 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 EXOC8Q8IYI6 725 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ULK2Q8IYT8 1036 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q8N1X5 172 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC9A6Q92581 669 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFKQ969G6 155 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRAMD1AQ96CP6 724 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF3Q9NR81 526 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 AQP12BA6NM10 295 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZAR1LA6NP61 321 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00473A8K010 186 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 LGALS16A8MUM7 142 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGPSO00116 658 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYT5O00445 386 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIP5K1BO14986 540 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 GLP2RO95838 553 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSTBP04080 98 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKCBP05771 671 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 DLDP09622 509 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD19P15391 556 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFB7P17568 137 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADRA1BP35368 520 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHKAP35790 457 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 MPLP40238 635 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRIA3P42263 894 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 GDF5P43026 501 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 TIRAPP58753 221 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXI1Q12951 378 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLCA4Q14CN2 919 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ST3GAL2Q16842 350 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZACNQ401N2 412 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC38Q502W7 563 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMTC4Q5T4D3 741 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 LAIR1Q6GTX8 287 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC174Q6PII3 467 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMER2Q8N7J2 671 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABHD5Q8WTS1 349 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 RSPRY1Q96DX4 576 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 RMDN3Q96TC7 470 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTPALQ9BTX7 342 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 TOR3AQ9H497 397 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYH16Q9H6N6 1097 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 OBP2BQ9NPH6 170 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRFN1Q9P244 771 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 STEAP1Q9UHE8 339 aa3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms