RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311160.13

TNS3-201, Transcript of tensin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS3, Length 7,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-201ENST00000311160 CHN2P52757 468 aa11.03□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 MTM1Q13496 603 aa11.03□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 NLRP10Q86W26 655 aa11.03□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 MCEMP1Q8IX19 187 aa11.03□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 OSBP2Q969R2 916 aa11.03□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa11.03□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.03□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 PPP2R2BQ00005 443 aa11.03□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.03□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11.03□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 C2orf81A6NN90 581 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 ASNSP08243 561 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 CPA2P48052 419 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 USP17L2Q6R6M4 530 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 ZNF333Q96JL9 665 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 PTPRHQ9HD43 1115 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 CD209Q9NNX6 404 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 SH3BGRLO75368 114 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 GRAP2O75791 330 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 ERCC2P18074 760 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 RPL4P36578 427 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 GCKRQ14397 625 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 ARL10Q8N8L6 244 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 ABCB6Q9NP58 842 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 TIAM1Q13009 1591 aa11.02□□□□□ -0.64
TNS3-201ENST00000311160 CTSWP56202 376 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 UGP2Q16851 508 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 OR2L3Q8NG85 312 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 POLD4Q9HCU8 107 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 EGFRP00533 1210 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 NFKB1P19838 968 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 CCNG1P51959 295 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 ITGA1P56199 1179 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 HSF2Q03933 536 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 PTK6Q13882 451 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 ZNF560Q96MR9 790 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 OSBPL11Q9BXB4 747 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 IGFLR1Q9H665 355 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 FSHRP23945 695 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 CASP9P55211 416 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 MEA1Q16626 185 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 LCORLQ8N3X6 602 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 CLHC1Q8NHS4 586 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 NR5A2O00482 541 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 HSD17B2P37059 387 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 SERPINB8P50452 374 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 NKD1Q969G9 470 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 PIGSQ96S52 555 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 TRABDQ9H4I3 376 aa11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 MAP3K5Q99683 1374 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 LAD1O00515 517 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 PMPCBO75439 489 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 ALCAMQ13740 583 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 TMEM26Q6ZUK4 368 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 ZNF248Q8NDW4 579 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 FAM167AQ96KS9 214 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 ZHX2Q9Y6X8 837 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 PLCG1P19174 1290 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 MAPK10P53779 464 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 CCDC153Q494R4 210 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 CCDC36Q8IYA8 594 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 CCT8L2Q96SF2 557 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 NAGPAQ9UK23 515 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 PLA2G4CQ9UP65 541 aa11.01□□□□□ -0.65
TNS3-201ENST00000311160 SUPT7LO94864 414 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms