RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 H0YIN7 160 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB7AO95365 584 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 INHBAP08476 426 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 TNNI1P19237 187 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 CHRNA5P30532 468 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 PTPN7P35236 360 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 BASP1P80723 227 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 TMPRSS15P98073 1019 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 MAP3K10Q02779 954 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 DLG1Q12959 904 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 TEX44Q53QW1 395 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 PPME1Q9Y570 386 aa21.38■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 TRIM49D1C9J1S8 452 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 AVILO75366 819 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 ALDH1B1P30837 517 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 SLC25A3Q00325 362 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 TKFCQ3LXA3 575 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 TAS1R3Q7RTX0 852 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 DHDDSQ86SQ9 333 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 LDHDQ86WU2 507 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 PDIK1LQ8N165 341 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 S100A14Q9HCY8 104 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 COPEO14579 308 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 CST8O60676 142 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 LYPLA2O95372 231 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 CD48P09326 243 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 PEX2P28328 305 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 CHI3L2Q15782 390 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 DNAL1Q4LDG9 190 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 LRRC38Q5VT99 294 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 SPATA24Q86W54 205 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 FAM71DQ8N9W8 422 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 USP6NLQ92738 828 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 C7orf26Q96N11 449 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 OLFM3Q96PB7 478 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 IKBKGQ9Y6K9 419 aa21.37■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 SPDYE6P0CI01 402 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 USP37Q86T82 979 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 I3L4J1 428 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 C1QAP02745 245 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 DNAJC24Q6P3W2 148 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 DCUN1D2Q6PH85 259 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 ANO5Q75V66 913 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 SP8Q8IXZ3 490 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.36■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 NFIBO00712 420 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 CCNE2O96020 404 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 VAV1P15498 845 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 IL1R2P27930 398 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 ACOT2P49753 483 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 MYBPC3Q14896 1274 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 RALGPS1Q5JS13 557 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 FBXL19Q6PCT2 694 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 ISLR2Q6UXK2 745 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 E2F7Q96AV8 911 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 AGBL1Q96MI9 1066 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 FAM210AQ96ND0 272 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 WWP1Q9H0M0 922 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 STK10O94804 968 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 C4orf19Q8IY42 314 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 POU5F2Q8N7G0 328 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 SLC13A1Q9BZW2 595 aa21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 UGT1A9O60656 530 aa21.34■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 PDE5AO76074 875 aa21.34■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 PGM3O95394 542 aa21.34■■□□□ 1.01
PMS1-222ENST00000639501 USP46P62068 366 aa21.34■■□□□ 1.01
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