RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 HERC6Q8IVU3 1022 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 DEFB106AQ8N104 65 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 SPATA18Q8TC71 538 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 VPS39Q96JC1 886 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 B3GALT6Q96L58 329 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 C16orf70Q9BSU1 422 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 RNF39Q9H2S5 420 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 TLK1Q9UKI8 766 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 TFR2Q9UP52 801 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa7.37□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 MAPK13O15264 365 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 RGS20O76081 388 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM253P0C7T8 217 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 MAB21L3Q8N8X9 362 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 TC2NQ8N9U0 490 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 MORC4Q8TE76 937 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 CNPY3Q9BT09 278 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 TBC1D13Q9NVG8 400 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 RSPH14Q9UHP6 348 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF197O14709 1029 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 APRTP07741 180 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 PAEPP09466 180 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 RBP3P10745 1247 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 PAMP19021 973 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 TTC8Q8TAM2 541 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 MBOAT7Q96N66 472 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 OSBPL8Q9BZF1 889 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 BRD9Q9H8M2 597 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM114A2Q9NRY5 505 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 NRAPQ86VF7 1730 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 CASZ1Q86V15 1759 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A0U1RQF3 1178 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 LSM8O95777 96 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 CBX1P83916 185 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 PDK1Q15118 436 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 CENPUQ71F23 418 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC13Q8IYE1 715 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 SPPL2BQ8TCT7 592 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 ING5Q8WYH8 240 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 EXT2Q93063 718 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 SERPINB11Q96P15 392 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 FZD8Q9H461 694 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC25A13Q9UJS0 675 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 KNL1Q8NG31 2342 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A1W2PQJ5 194 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 ERICH4A6NGS2 130 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC188H7C350 402 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 PMPCBO75439 489 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 ACADMP11310 421 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 EDNRBP24530 442 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 AKT1P31749 480 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 OXCT1P55809 520 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 MTM1Q13496 603 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 RAD9BQ6WBX8 426 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 CROCCP2Q86T23 111 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 LGI2Q8N0V4 545 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC25A41Q8N5S1 370 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 IPMKQ8NFU5 416 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.36□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 NRP1O14786 923 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 TLR5O60602 858 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 CYP2F1P24903 491 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 GGCXP38435 758 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 SLMAPQ14BN4 828 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 TTC23LQ6PF05 361 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 SERINC5Q86VE9 423 aa7.35□□□□□ -1.23
LRRTM3-201ENST00000361320 NUP93Q8N1F7 819 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms