RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572445.1

PRPF8-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-204ENST00000572445 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 THP07101 528 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 OR52Z1P0C646 297 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 SP9P0CG40 484 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 GRIA2P42262 883 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 CLCNKBP51801 687 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 NEK4P51957 841 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 GSTM4Q03013 218 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 ST3GAL1Q11201 340 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 STRN3Q13033 797 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 BIRC2Q13490 618 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 MAPK6Q16659 721 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 FBXL16Q8N461 479 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 ERMNQ8TAM6 284 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 CDH7Q9ULB5 785 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 USP18Q9UMW8 372 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 FAM170BA6NMN3 283 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 PROB1E7EW31 1015 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 TBX1O43435 398 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 LAMTOR5O43504 91 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 AKAP10O43572 662 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 AVPP01185 164 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 LRG1P02750 347 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 RHOP08100 348 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 ARAFP10398 606 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 MYL4P12829 197 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 CDC25AP30304 524 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 NEK2P51955 445 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 PEX3P56589 373 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 PPP2R2AP63151 447 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 CREMQ03060 361 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 TTC38Q5R3I4 469 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 HDXQ7Z353 690 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 C8orf76Q96K31 380 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 IFT74Q96LB3 600 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 CHST7Q9NS84 486 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 WNT16Q9UBV4 365 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 DPP7Q9UHL4 492 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 COL4A2P08572 1712 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 SCN1AP35498 2009 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 A0A1B0GUA9 196 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 FAM187AA6NFU0 413 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 E9PMD0 336 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 H3BRJ5 948 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 PODXLO00592 558 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-204ENST00000572445 SLC16A4O15374 487 aa6.84□□□□□ -1.31
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