RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546480.1

VENTXP3-201, Transcript of VENT homeobox pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene VENTXP3, Length 773 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VENTXP3-201ENST00000546480 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.6□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.6□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.6□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 BRD9Q9H8M2 597 aa14.6□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.6□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.6□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.6□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 KCNJ18B7U540 433 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 CKMP06732 381 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 TPM2P07951 284 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 PSMC3P17980 439 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 FCARP24071 287 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 YWHAQP27348 245 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 GDI1P31150 447 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 SLC8A3P57103 927 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 KCNJ12Q14500 433 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 MAN2A1Q16706 1144 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 TMEM270Q6UE05 265 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 VITQ6UXI7 678 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 GBP6Q6ZN66 633 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 KAT5Q92993 513 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 ASIC4Q96FT7 647 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 MYO10Q9HD67 2058 aa14.59□□□□□ -0.07
VENTXP3-201ENST00000546480 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 ZNF263O14978 683 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 PMM2O15305 246 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 TADA3O75528 432 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 BEST1O76090 585 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 PRAMEF12O95522 483 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 KRT5P13647 590 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 PTMSP20962 102 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 RAD23BP54727 409 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 PFKPQ01813 784 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 TYRO3Q06418 890 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 TAF10Q12962 218 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 SGO2Q562F6 1265 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 E2F7Q96AV8 911 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 MYRFLQ96LU7 910 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 SMOQ99835 787 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 HESX1Q9UBX0 185 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.58□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 C2orf78A6NCI8 922 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 USP17L7P0C7H9 530 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 NPR3P17342 541 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 SLC9A1P19634 815 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 USP8P40818 1118 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 VWA3BQ502W6 1294 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 NACA2Q9H009 215 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 NDST4Q9H3R1 872 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 WNT16Q9UBV4 365 aa14.57□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.56□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 TTC28Q96AY4 2481 aa14.56□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 VDRP11473 427 aa14.56□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 PPP3CCP48454 512 aa14.56□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 PDE6CP51160 858 aa14.56□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 MFAP3P55082 362 aa14.56□□□□□ -0.08
VENTXP3-201ENST00000546480 MYL5Q02045 173 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms