RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487876.1

RPSA-208, Transcript of ribosomal protein SA, human

TSL 4

Gene RPSA, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPSA-208	ENST00000487876	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	C2orf78	A6NCI8	922 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	DPYSL4	O14531	572 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF263	O14978	683 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TRIM66	O15016	1216 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CD58	P19256	250 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	WEE1	P30291	646 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	GTF2H1	P32780	548 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	AVPR1A	P37288	418 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	SOX9	P48436	509 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	PRKCQ	Q04759	706 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	INCA1	Q0VD86	236 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	MON1A	Q86VX9	555 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	C12orf29	Q8N999	325 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TTC8	Q8TAM2	541 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	WHAMM	Q8TF30	809 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	NELFB	Q8WX92	580 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	E2F7	Q96AV8	911 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TNIP3	Q96KP6	325 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	PRRX2	Q99811	253 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	ARID3A	Q99856	593 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CHAD	O15335	359 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	NUBP1	P53384	320 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	STX17	P56962	302 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TNK2	Q07912	1038 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	RAB20	Q9NX57	234 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	OBP2A	Q9NY56	170 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RPSA-208	ENST00000487876	ATP8B3	O60423	1300 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	FAM170B	A6NMN3	283 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	STX10	O60499	249 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	AP1G2	O75843	785 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	BEST1	O76090	585 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	ADORA2B	P29275	332 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	TAF10	Q12962	218 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	UNC93A	Q86WB7	457 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	TTC16	Q8NEE8	873 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	TATDN2	Q93075	761 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	CEP63	Q96MT8	703 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	SMO	Q99835	787 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	TDP1	Q9NUW8	608 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	GCNT4	Q9P109	453 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	CILP	O75339	1184 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	CKM	P06732	381 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	PPP1R2	P41236	205 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	SLC5A3	P53794	718 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	PAK1	Q13153	545 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	FZD5	Q13467	585 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	ANGPT1	Q15389	498 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF394	Q53GI3	561 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPSA-208	ENST00000487876	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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