RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF263O14978 683 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 AVPR1AP37288 418 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CLCN5P51795 746 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CUL2Q13617 745 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 YAF2Q8IY57 180 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 IRF7Q92985 503 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 SHDQ96IW2 340 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 SMOQ99835 787 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 OBP2AQ9NY56 170 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 NCANO14594 1321 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 BEST1O76090 585 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 PRAMEF12O95522 483 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 ADORA2BP29275 332 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 TAF10Q12962 218 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 LMO3Q8TAP4 145 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT82Q9NSB4 513 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 DACH1Q9UI36 760 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFRSF10BO14763 440 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 PI15O43692 258 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 YWHAQP27348 245 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP3CCP48454 512 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 RAD23BP54727 409 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP3K7CLP57077 242 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 STARD6P59095 220 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 PRKCQQ04759 706 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D17Q9HA65 648 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 TDP1Q9NUW8 608 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 C2orf78A6NCI8 922 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CHADO15335 359 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM200BP0CF97 657 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 HDCP19113 662 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 RFX1P22670 979 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 BPIFB1Q8TDL5 484 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 DNASE1L2Q92874 299 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 NT5C1BQ96P26 610 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 HEBP1Q9NRV9 189 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 COMMD8Q9NX08 183 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 IL37Q9NZH6 218 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CCL26Q9Y258 94 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 ABL1P00519 1130 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L7P0C7H9 530 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 AOC1P19801 751 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC5A3P53794 718 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC22A12Q96S37 553 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 THAP9Q9H5L6 903 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 GCNT4Q9P109 453 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO32Q969P5 355 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 DUSP16Q9BY84 665 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 ARNTLO00327 626 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 MBD3O95983 291 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CKMP06732 381 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 PFKLP17858 780 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CD72P21854 359 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 RRAGAQ7L523 313 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-204ENST00000416021 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.33■■□□□ 1.17
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