RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 FUKQ8N0W3 1084 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM105Q8N8V8 129 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 TRIML1Q8N9V2 468 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 FBXL13Q8NEE6 735 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 RIN3Q8TB24 985 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 MYRFLQ96LU7 910 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 CEP63Q96MT8 703 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 KCNK16Q96T55 309 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 ELOVL4Q9GZR5 314 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 TRPV4Q9HBA0 871 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 ZFP14Q9HCL3 533 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 RAB20Q9NX57 234 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 WNT16Q9UBV4 365 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 COQ4Q9Y3A0 265 aa11.44□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 P4HA1P13674 534 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 CD58P19256 250 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 CDC25CP30307 473 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 PPP1R2P41236 205 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 TAF12Q16514 161 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 FAM35AQ86V20 835 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 CRYBG2Q8N1P7 616 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 ZMIZ2Q8NF64 920 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 FLCNQ8NFG4 579 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 SPATA17Q96L03 361 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 C8orf48Q96LL4 319 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 SLC22A12Q96S37 553 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 TASP1Q9H6P5 420 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 FAM49BQ9NUQ9 324 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 CCL26Q9Y258 94 aa11.43□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 BICDL2A1A5D9 508 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 ARNTLO00327 626 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 CILPO75339 1184 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 FGF19O95750 216 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 AVPR2P30518 371 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 FMO5P49326 533 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 LRMPQ12912 555 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 DPCR1Q3MIW9 517 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC40Q4G0X9 1142 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 SLC44A4Q53GD3 710 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 UNC93AQ86WB7 457 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 IRF2BP1Q8IU81 584 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 TRIM59Q8IWR1 403 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 LMO3Q8TAP4 145 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 SLC2A14Q8TDB8 520 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 CYP2S1Q96SQ9 504 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 SMOQ99835 787 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 IMPG2Q9BZV3 1241 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 GPR88Q9GZN0 384 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 NUP62CLQ9H1M0 184 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 RWDD2AQ9UIY3 292 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 DMDP11532 3685 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 KMT2EQ8IZD2 1858 aa11.42□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 GREB1Q4ZG55 1949 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 OBSL1O75147 1896 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 C2orf78A6NCI8 922 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 TNFRSF10BO14763 440 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 TRIM66O15016 1216 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 STX10O60499 249 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 PSMC3P17980 439 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 CD72P21854 359 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 ADORA2BP29275 332 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 WEE1P30291 646 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 GDI1P31150 447 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 PGFP49763 221 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 RAD23BP54727 409 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 MARSP56192 900 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 ZXDBP98169 803 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 FCHO2Q0JRZ9 810 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF394Q53GI3 561 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 MON1AQ86VX9 555 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 MFSD6LQ8IWD5 586 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 CMTM8Q8IZV2 173 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 UBR7Q8N806 425 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 SLC4A11Q8NBS3 891 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 PRSS33Q8NF86 280 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 SCAMP5Q8TAC9 235 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 KAT5Q92993 513 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 TNIP3Q96KP6 325 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 GCNAQ96QF7 691 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 MED10Q9BTT4 135 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 TTLL2Q9BWV7 592 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 NT5C1AQ9BXI3 368 aa11.41□□□□□ -0.58
ATG4B-210ENST00000428861 FOXQ1Q9C009 403 aa11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms