RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 FAM189A1O60320 539 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 HBP1O60381 514 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 TGFB3P10600 412 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 HHATQ5VTY9 493 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 E2F8A0AVK6 867 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 CDH16O75309 829 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 GPATCH11Q8N954 259 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 FBXO36Q8NEA4 188 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 USP18Q9UMW8 372 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 MCM3APO60318 1980 aa20.62■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 ASAP2O43150 1006 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 C3orf20Q8ND61 904 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 SERPINB12Q96P63 405 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 PIGRP01833 764 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 KRT4P19013 534 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 KLRC2P26717 231 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 FOXN2P32314 431 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 TCEAL1Q15170 157 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 CENPUQ71F23 418 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 DPP3Q9NY33 737 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 H3BRB1 525 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 KDELR1P24390 212 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 NUMBP49757 651 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 ALLCQ8N6M5 410 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 ACAP3Q96P50 834 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 SMC6Q96SB8 1091 aa20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 PRPSAP2O60256 369 aa20.6■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 FAM155BO75949 473 aa20.6■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 KCNJ2P63252 427 aa20.6■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 FBF1Q8TES7 1133 aa20.6■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.6■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 MCF2LO15068 1137 aa20.6■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 KCNN4O15554 427 aa20.6■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 XYLT1Q86Y38 959 aa20.6■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.6■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.6■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 MED7O43513 233 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 RPSAP08865 295 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 EDNRBP24530 442 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 ATP5DP30049 168 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF132P52740 706 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 FAF2Q96CS3 445 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 PEBP4Q96S96 227 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 A8MUI8 341 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 GJA5P36382 358 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 SPATA21Q7Z572 469 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 IKBKGQ9Y6K9 419 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 C22orf31O95567 290 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 APRTP07741 180 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 P3H4Q92791 437 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 ECT2Q9H8V3 914 aa20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 ABLIM1O14639 778 aa20.58■□□□□ 0.89
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM63AO94886 807 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.9 ms