RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334268.8

TRDN-201, Transcript of triadin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 4,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-201ENST00000334268 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 FAM47CQ5HY64 1035 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 NT5DC1Q5TFE4 455 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 EFCAB12Q6NXP0 572 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 GALNT13Q8IUC8 556 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 MIER2Q8N344 545 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ARRDC4Q8NCT1 418 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 LRRN4Q8WUT4 740 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PPP1R16BQ96T49 567 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 TBCBQ99426 244 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 NUP62CLQ9H1M0 184 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 DNAJC25Q9H1X3 360 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 SUFUQ9UMX1 484 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 NRCAMQ92823 1304 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 MOXD2PA6NHM9 499 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 DNM1LO00429 736 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ENC1O14682 589 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 MAFO75444 373 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 VTNP04004 478 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 GLRA2P23416 452 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 GUCY2CP25092 1073 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ATP5DP30049 168 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 NMT1P30419 496 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PEX3P56589 373 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 GALK2Q01415 458 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ARID5BQ14865 1188 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 GPNMBQ14956 572 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 KMT5BQ4FZB7 885 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 RASIP1Q5U651 963 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 FAM160B1Q5W0V3 765 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 C1orf94Q6P1W5 598 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 RUFY4Q6ZNE9 571 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 RGL4Q8IZJ4 473 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 SLC43A3Q8NBI5 491 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 MDM1Q8TC05 714 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 DNAJB3Q8WWF6 145 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 OMA1Q96E52 524 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 CUEDC2Q9H467 287 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 CBX8Q9HC52 389 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 SLC39A2Q9NP94 309 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 CASS4Q9NQ75 786 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 NRBP2Q9NSY0 501 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 NDOR1Q9UHB4 597 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 RSPH14Q9UHP6 348 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PHF24Q9UPV7 400 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 AURKCQ9UQB9 309 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 GINS2Q9Y248 185 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 UMODL1Q5DID0 1318 aa3.29□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 TISP43B9A030 160 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 MAP3K13O43283 966 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 RIPK2O43353 540 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 B4GALT4O60513 344 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 SIN3BO75182 1162 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 TFRCP02786 760 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 MPSTP25325 297 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ITGB8P26012 769 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ARL2P36404 184 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ASIC1P78348 528 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ARF5P84085 180 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 IL1RL1Q01638 556 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PRKG2Q13237 762 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 EMC2Q15006 297 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 KIZQ2M2Z5 673 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ANKDD1AQ495B1 522 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 NUGGCQ68CJ6 796 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PGBD2Q6P3X8 592 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PKN3Q6P5Z2 889 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 MTHFD1LQ6UB35 978 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 CCDC121Q6ZUS5 278 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 SERINC5Q86VE9 423 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 SFR1Q86XK3 245 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 FAM126BQ8IXS8 530 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 TXLNBQ8N3L3 684 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 TCAIMQ8N3R3 496 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 METTL13Q8N6R0 699 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 RIN3Q8TB24 985 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 ASAP3Q8TDY4 903 aa3.28□□□□□ -1.88
TRDN-201ENST00000334268 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms