RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 TMEM237Q96Q45 408 aa29.37■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 C2orf40Q9H1Z8 148 aa29.37■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 ZWILCHQ9H900 591 aa29.37■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA8SH3BPF8 625 aa29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA8MH3BSY2 632 aa29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 HGSO14964 777 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 DYNLT1P63172 113 aa29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 LVRNQ6Q4G3 990 aa29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 EXOC8Q8IYI6 725 aa29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 A8MUI8 341 aa29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 VGLL4Q14135 290 aa29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 TFDP1Q14186 410 aa29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 NSMCE1Q8WV22 266 aa29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 SEPT1Q8WYJ6 367 aa29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 CYLDQ9NQC7 956 aa29.36■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 TM9SF1O15321 606 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 B4GALT4O60513 344 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 IL1R2P27930 398 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 RPL22P35268 128 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 GDF10P55107 478 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 FNBP1LQ5T0N5 605 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD22Q5VYY1 191 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 RHPN2Q8IUC4 686 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 FAXDC2Q96IV6 333 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 PAFAH2Q99487 392 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 BANF1O75531 89 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 TGFB3P10600 412 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 EDNRBP24530 442 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 SMTNL2Q2TAL5 461 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 FYB2Q5VWT5 728 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 JOSD2Q8TAC2 188 aa29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 PROZP22891 400 aa29.34■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 SSTR1P30872 391 aa29.34■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 RASSF2P50749 326 aa29.34■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 SLC8A3P57103 927 aa29.34■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 ACAP1Q15027 740 aa29.34■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 MPZL3Q6UWV2 235 aa29.34■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 PDIK1LQ8N165 341 aa29.34■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 OTOFQ9HC10 1997 aa29.34■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 PTPRFP10586 1907 aa29.34■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 APOC2P02655 101 aa29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 CD19P15391 556 aa29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 MSS51Q4VC12 460 aa29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 METTL7BQ6UX53 244 aa29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 RNF149Q8NC42 400 aa29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 RNF181Q9P0P0 153 aa29.33■■■□□ 2.29
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UBP1-201ENST00000283628 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
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UBP1-201ENST00000283628 DLK2Q6UY11 383 aa29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 OTOAQ7RTW8 1153 aa29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 PALM2Q8IXS6 379 aa29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 FBXO36Q8NEA4 188 aa29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 MZB1Q8WU39 189 aa29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 BCO2Q9BYV7 579 aa29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 CYTH4Q9UIA0 394 aa29.33■■■□□ 2.29
UBP1-201ENST00000283628 ANK1P16157 1881 aa29.32■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 C2CD2LO14523 706 aa29.32■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 KCNT1Q5JUK3 1230 aa29.32■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 XYLT1Q86Y38 959 aa29.32■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 GAD2Q05329 585 aa29.32■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa29.32■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 KCTD6Q8NC69 237 aa29.32■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 VPS11Q9H270 941 aa29.32■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 PTPRHQ9HD43 1115 aa29.32■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 ADM5C9JUS6 153 aa29.31■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 RPSAP08865 295 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 TARSP26639 723 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 CCNG1P51959 295 aa29.31■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP29.31■■■□□ 2.284e-6■■■■□ 26.1
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UBP1-201ENST00000283628 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 SYNCQ9H7C4 482 aa29.31■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa29.3■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 MCF2LO15068 1137 aa29.3■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 IL18RAPO95256 599 aa29.3■■■□□ 2.28
UBP1-201ENST00000283628 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP29.3■■■□□ 2.28
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