RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 MYPNQ86TC9 1320 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 LPXNO60711 386 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ETS1P14921 441 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ARMCX1Q9P291 453 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 CAPN14A8MX76 684 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 GOLGA8RI6L899 631 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 FKBP6O75344 327 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 CPA2P48052 419 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 MAP7Q14244 749 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 MON1BQ7L1V2 547 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ULK2Q8IYT8 1036 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 RAB20Q9NX57 234 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 DENND3A2RUS2 1198 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ZBTB7AO95365 584 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 IMPDH2P12268 514 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 CFAP157Q5JU67 520 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 PCGF5Q86SE9 256 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 NLRX1Q86UT6 975 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 JDP2Q8WYK2 163 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 APOPT1Q96IL0 206 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 BANF1O75531 89 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 BAG2O95816 211 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ENO1P06733 434 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 BGNP21810 368 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ETV4P43268 484 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 RARRES1P49788 294 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 VCPP55072 806 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 KAZNQ674X7 775 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 TRIM74Q86UV6 250 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 TRIM73Q86UV7 250 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 TTC1Q99614 292 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 PIM2Q9P1W9 311 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 USTQ9Y2C2 406 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 RIPK3Q9Y572 518 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXA11-201ENST00000006015 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 KLF11O14901 512 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 MT-ND3P03897 115 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 ETS2P15036 469 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 SSTR1P30872 391 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 GCNT1Q02742 428 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 MYBPC3Q14896 1274 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 C1orf146Q5VVC0 180 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 HIC2Q96JB3 615 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 EBF3Q9H4W6 596 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 LGR5O75473 907 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 CALCAP01258 141 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 KRT10P13645 584 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 GTF2BQ00403 316 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 PGM5Q15124 567 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 AAGABQ6PD74 315 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 SPATA24Q86W54 205 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 TTC17Q96AE7 1141 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 MTBPQ96DY7 904 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 SLC7A8Q9UHI5 535 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXA11-201ENST00000006015 TAGLN3Q9UI15 199 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms