RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 P2RY13Q9BPV8 354 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 SMOC1Q9H4F8 434 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF3C4Q9UKN8 822 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOC7Q9UPT5 735 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 TCHHQ07283 1943 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 TPRP12270 2363 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 OBSL1O75147 1896 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNA1BQ00975 2339 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 ACACBO00763 2458 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 HUS1O60921 280 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 DRD1P21728 446 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 AMPD2Q01433 879 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM160A1Q05DH4 1040 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF77Q15935 545 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC52Q8N7C0 313 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 MYRFLQ96LU7 910 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2S1Q96SQ9 504 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 ECT2Q9H8V3 914 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPC7Q9HCX4 862 aa27.55■■■□□ 2
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CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8IPA6NC78 632 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8JA6NMD2 632 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 TM4SF5O14894 197 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAP3O75969 853 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 GCNT3O95395 438 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 MYL7Q01449 175 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 USP4Q13107 963 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 ST3GAL2Q16842 350 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G2CQ5R387 149 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM86AQ8N2M4 240 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 CPA6Q8N4T0 437 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMKK1Q8N5S9 505 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC16Q8NEE8 873 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC39Q9UFE4 941 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 SIX4Q9UIU6 781 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX9Q9Y5X1 595 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT6Q9Y6F9 365 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 GAP43P17677 238 aa27.53■■■□□ 2
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CAPNS1-211ENST00000590874 OSCP1Q8WVF1 389 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 CBWD1Q9BRT8 395 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 GDAP2Q9NXN4 497 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGA11Q9UKX5 1188 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 DENND4CQ5VZ89 1909 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT19P08727 400 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 GARTP22102 1010 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 MPLP40238 635 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 PLK5Q496M5 336 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP221Q4G0U5 840 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO43Q4G163 708 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 RRAGBQ5VZM2 374 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRF2Q8IZF7 708 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 CLIC6Q96NY7 704 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 MTMR12Q9C0I1 747 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM206Q9H813 350 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE11AQ9HCR9 933 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 GREB1Q4ZG55 1949 aa27.51■■■□□ 2
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 GABRDO14764 452 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 LDHAP00338 332 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 CKMP06732 381 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L7P0C7H9 530 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 STPG1Q5TH74 334 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SV2BQ7L1I2 683 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
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CAPNS1-211ENST00000590874 CD101Q93033 1021 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 OLFML3Q9NRN5 406 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 GCNT4Q9P109 453 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf78A6NCI8 922 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNAR2P48551 515 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 RBP5P82980 135 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SOWAHAQ2M3V2 549 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 EML3Q32P44 896 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SYT13Q7L8C5 426 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SCN4BQ8IWT1 228 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SYCP3Q8IZU3 236 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA18Q8TC71 538 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP2A3Q93084 1043 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 PCIF1Q9H4Z3 704 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa27.5■■□□□ 1.99
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