RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 HSPBAP1Q96EW2 488 aa5.54□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SLC35A4Q96G79 324 aa5.54□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.54□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.54□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 PCDHA6Q9UN73 950 aa5.54□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa5.54□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 PRRT4C9JH25 899 aa5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 PPP6CO00743 305 aa5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 CERS1P27544 350 aa5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 PXNP49023 591 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 IQCB1Q15051 598 aa5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 CCDC157Q569K6 752 aa5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 MORN5Q5VZ52 161 aa5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 SLC2A7Q6PXP3 512 aa5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 LRRC71Q8N4P6 559 aa5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 GLG1Q92896 1179 aa5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 R3HDM4Q96D70 268 aa5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 MVB12AQ96EY5 273 aa5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.53□□□□□ -1.52
SSB-211ENST00000490914 MYO1FO00160 1098 aa5.52□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 ONECUT2O95948 504 aa5.52□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 GRPP07492 148 aa5.52□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 PDE1AP54750 535 aa5.52□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 CHSY1Q86X52 802 aa5.52□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.52□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 CYP2W1Q8TAV3 490 aa5.52□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 FSD1LQ9BXM9 530 aa5.52□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 BHMT2Q9H2M3 363 aa5.52□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 GLOD4Q9HC38 313 aa5.52□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa5.52□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.52□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 A1L4Q6 167 aa5.51□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 hCG_1984214I3L0E3 225 aa5.51□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 ERC2O15083 957 aa5.51□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 ALDH2P05091 517 aa5.51□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 KCNJ5P48544 419 aa5.51□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 MAPK7Q13164 816 aa5.51□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.51□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 ZBTB9Q96C00 473 aa5.51□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.51□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 ARMT1Q9H993 441 aa5.51□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa5.51□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 ADAMTS3O15072 1205 aa5.5□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 PDE8BO95263 885 aa5.5□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 TUBB4AP04350 444 aa5.5□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa5.5□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 ZBTB46Q86UZ6 589 aa5.5□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 ZNF280BQ86YH2 543 aa5.5□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 XAGE5Q8WWM1 108 aa5.5□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 HPS3Q969F9 1004 aa5.5□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 CHMP4CQ96CF2 233 aa5.5□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 FCRL4Q96PJ5 515 aa5.5□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 CGRRF1Q99675 332 aa5.5□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 PDGFCQ9NRA1 345 aa5.5□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 HOMER2Q9NSB8 354 aa5.5□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 XPR1Q9UBH6 696 aa5.5□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 ZNF521Q96K83 1311 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 IKBKBO14920 756 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 MOSPD3O75425 235 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 IGKV2-30P06310 120 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 CSF1RP07333 972 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 NPSP0C0P6 89 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 AKAP5P24588 427 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 PTGER1P34995 402 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 VIPR2P41587 438 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 UCP3P55916 312 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 E2F2Q14209 437 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 AMOTQ4VCS5 1084 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 TRIM72Q6ZMU5 477 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 Q6ZWC4 215 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 RITA1Q96K30 269 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 C5orf34Q96MH7 638 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 STAP2Q9UGK3 403 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 CPA4Q9UI42 421 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.49□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 ADORA2AP29274 412 aa5.48□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 ARHGAP25P42331 645 aa5.48□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SSB-211ENST00000490914 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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