RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 ARHGAP25P42331 645 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 LIFRP42702 1097 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 ME1P48163 572 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 LIG3P49916 1009 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 ARPP19P56211 112 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SKOR1P84550 965 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 AMPD2Q01433 879 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SCRN1Q12765 414 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 PSMD2Q13200 908 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 TUSC3Q13454 348 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 DMC1Q14565 340 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 FBXO43Q4G163 708 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 XKR3Q5GH77 459 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 LYSMD4Q5XG99 296 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 NOTUMQ6P988 496 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SYT13Q7L8C5 426 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 TTC30AQ86WT1 665 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 MINDY1Q8N5J2 469 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 TC2NQ8N9U0 490 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 FANCBQ8NB91 859 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 RDM1Q8NG50 284 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 LENG9Q96B70 501 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SPACA7Q96KW9 195 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 RIT2Q99578 217 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 BARHL2Q9NY43 387 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 KLK14Q9P0G3 267 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 NCANO14594 1321 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 TENM4Q6N022 2769 aa6.95□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SPTA1P02549 2419 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 ESYT2A0FGR8 921 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 CHMP2AO43633 222 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SLC28A2O43868 658 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 JAK2O60674 1132 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 GAS7O60861 476 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 CLSTN1O94985 981 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 STBD1O95210 358 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 EGFP01133 1207 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SYPP08247 313 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 DRD1P21728 446 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 FECHP22830 423 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 AKAP5P24588 427 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 ITPKBP27987 946 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 NDUFA8P51970 172 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SMTNP53814 917 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 VSNL1P62760 191 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 TNK2Q07912 1038 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 FUT2Q10981 343 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 STIM1Q13586 685 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 PRR16Q569H4 304 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 EMC10Q5UCC4 262 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 MICU3Q86XE3 530 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 NAXDQ8IW45 347 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC148Q8NFR7 591 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 CEP76Q8TAP6 659 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SPATA18Q8TC71 538 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 CPB2Q96IY4 423 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 SH3GL2Q99962 352 aa6.94□□□□□ -1.3
HDAC6-210ENST00000441703 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.94□□□□□ -1.3
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