RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYL7Q01449 175 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP4Q13107 963 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF77Q15935 545 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDR2Q16832 855 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO43Q4G163 708 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYMQ7RTS9 669 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRAPQ7Z569 592 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPA6Q8N4T0 437 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACBD6Q9BR61 282 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STRA6Q9BX79 667 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ECT2Q9H8V3 914 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCB6Q9NP58 842 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TM4SF5O14894 197 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HUS1O60921 280 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP2F1P24903 491 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMLP29590 882 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALK1P51570 392 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLK5Q496M5 336 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STPG1Q5TH74 334 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAAL1Q96ER3 474 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYRFLQ96LU7 910 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKMYT1Q99640 499 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM206Q9H813 350 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STK17AQ9UEE5 414 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.15□□□□□ -0.14
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CKMP06732 381 aa14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFNAR2P48551 515 aa14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNA1Q09470 495 aa14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP49Q70CQ1 688 aa14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYT13Q7L8C5 426 aa14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSTM1Q86WC4 334 aa14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA18Q8TC71 538 aa14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD101Q93033 1021 aa14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP2A3Q93084 1043 aa14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACDQ96AP0 544 aa14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPSTI1Q96J88 318 aa14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACCSQ96QU6 501 aa14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS45Q9NRW7 570 aa14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.14□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCNT3O95395 438 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APBB3O95704 486 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP17L7P0C7H9 530 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAP43P17677 238 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELF2Q15723 593 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC142Q17RM4 750 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EML3Q32P44 896 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC16Q8NEE8 873 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXorf38Q8TB03 319 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A12Q96S37 553 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX9Q9Y5X1 595 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAMA1P25391 3075 aa14.13□□□□□ -0.15
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYMKA6NI61 221 aa14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms