RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343916.7

COL9A3-201, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL9A3, Length 2,485 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-201ENST00000343916 DNM1LO00429 736 aa20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 MED7O43513 233 aa20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 TAF5Q15542 800 aa20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 AFG1LQ8WV93 481 aa20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 YY1AP1Q9H869 796 aa20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 GOLGA8MH3BSY2 632 aa20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 MICAL2O94851 1124 aa20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 BRAFP15056 766 aa20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 GDF10P55107 478 aa20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 GDAP1Q8TB36 358 aa20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 CCDC134Q9H6E4 229 aa20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 ASB14A6NK59 587 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 M0QYV0 167 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 CST8O60676 142 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 CILPO75339 1184 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 BANF1O75531 89 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 RELL1Q8IUW5 271 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 CCDC197Q8NCU1 140 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 UBA3Q8TBC4 463 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 ACTL9Q8TC94 416 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 CDH16O75309 829 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 ATP5DP30049 168 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 ILDR2Q71H61 639 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 CENPFP49454 3210 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 TCEA3O75764 348 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 PTPN7P35236 360 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 GAD2Q05329 585 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 HPDLQ96IR7 371 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 ITGAVP06756 1048 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 MCF2P10911 925 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 ADORA2AP29274 412 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 MTM1Q13496 603 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 TMED2Q15363 201 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 NLRP7Q8WX94 980 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 CCT6BQ92526 530 aa20.35■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 KDELR1P24390 212 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 LAMC2Q13753 1193 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 STAT4Q14765 748 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 RAB6CQ53S08 254 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 HSPH1Q92598 858 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 GPD2P43304 727 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 TMEM132DQ14C87 1099 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 HADHQ16836 314 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 FAM187BQ17R55 369 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 CCDC77Q9BR77 488 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 EURLQ9NYK6 297 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.34■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa20.33■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 KRT7P08729 469 aa20.33■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 GCAP28676 217 aa20.33■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 MIPP30301 263 aa20.33■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 NRLP54845 237 aa20.33■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 GPATCH11Q8N954 259 aa20.33■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 FNIP1Q8TF40 1166 aa20.33■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.33■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.33■□□□□ 0.85
COL9A3-201ENST00000343916 RASA4BC9J798 803 aa20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms