RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 CPT1BQ92523 772 aa22.57■■□□□ 1.2
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PTDSS1-201ENST00000337004 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.57■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 TFDP1Q14186 410 aa22.57■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 BBS12Q6ZW61 710 aa22.57■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.57■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 PCYT2Q99447 389 aa22.57■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 CLUHO75153 1309 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 SMAPO00193 183 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 MED7O43513 233 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 BANF1O75531 89 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 RASSF2P50749 326 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 MICALL2Q8IY33 904 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 INPP5DQ92835 1189 aa22.56■■□□□ 1.2
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PTDSS1-201ENST00000337004 LHX5Q9H2C1 402 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 LRCH4O75427 683 aa22.56■■□□□ 1.2
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PTDSS1-201ENST00000337004 KDELR1P24390 212 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 SSTR1P30872 391 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 FSTL1Q12841 308 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 FYB2Q5VWT5 728 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 PALM2Q8IXS6 379 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 CHST13Q8NET6 341 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM237Q96Q45 408 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 CD19P15391 556 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 ASPAP45381 313 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 GDF10P55107 478 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC8A3P57103 927 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 CNTN2Q02246 1040 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 PTPN20Q4JDL3 420 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 IER5Q5VY09 327 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 C10orf82Q8WW14 230 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 HAO1Q9UJM8 370 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 DIAPH2O60879 1101 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.55■■□□□ 1.2
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PTDSS1-201ENST00000337004 RPL22P35268 128 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 CRYMQ14894 314 aa22.55■■□□□ 1.2
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PTDSS1-201ENST00000337004 SPDYAQ5MJ70 313 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 OTOAQ7RTW8 1153 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 PDIK1LQ8N165 341 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 PAFAH2Q99487 392 aa22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 WDR81Q562E7 1941 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 E7ESA3 106 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 TNNC2P02585 160 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 PRKCBP05771 671 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 IL1R2P27930 398 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 PIM2Q9P1W9 311 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 PPME1Q9Y570 386 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 TM9SF1O15321 606 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 GAD2Q05329 585 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 TAZQ16635 292 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 MSS51Q4VC12 460 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 KCTD6Q8NC69 237 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 JOSD2Q8TAC2 188 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 SYNCQ9H7C4 482 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 CYLDQ9NQC7 956 aa22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 TSHRP16473 764 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 PSMC4P43686 418 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF398Q8TD17 642 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1-201ENST00000337004 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
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